Protein–RNA interactions for Protein: Q96L92

SNX27, Sorting nexin-27, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX27Q96L92 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
SNX27Q96L92 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SNX27Q96L92 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SNX27Q96L92 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SNX27Q96L92 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SNX27Q96L92 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SNX27Q96L92 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SNX27Q96L92 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SNX27Q96L92 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
SNX27Q96L92 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SNX27Q96L92 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SNX27Q96L92 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SNX27Q96L92 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SNX27Q96L92 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SNX27Q96L92 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SNX27Q96L92 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SNX27Q96L92 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SNX27Q96L92 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SNX27Q96L92 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SNX27Q96L92 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SNX27Q96L92 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SNX27Q96L92 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SNX27Q96L92 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SNX27Q96L92 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SNX27Q96L92 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SNX27Q96L92 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SNX27Q96L92 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SNX27Q96L92 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SNX27Q96L92 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SNX27Q96L92 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SNX27Q96L92 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SNX27Q96L92 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SNX27Q96L92 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SNX27Q96L92 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SNX27Q96L92 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SNX27Q96L92 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SNX27Q96L92 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SNX27Q96L92 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SNX27Q96L92 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SNX27Q96L92 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SNX27Q96L92 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SNX27Q96L92 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SNX27Q96L92 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SNX27Q96L92 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SNX27Q96L92 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SNX27Q96L92 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SNX27Q96L92 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SNX27Q96L92 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SNX27Q96L92 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SNX27Q96L92 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SNX27Q96L92 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SNX27Q96L92 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SNX27Q96L92 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SNX27Q96L92 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SNX27Q96L92 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SNX27Q96L92 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SNX27Q96L92 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SNX27Q96L92 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SNX27Q96L92 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SNX27Q96L92 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SNX27Q96L92 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SNX27Q96L92 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SNX27Q96L92 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SNX27Q96L92 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SNX27Q96L92 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SNX27Q96L92 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SNX27Q96L92 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SNX27Q96L92 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SNX27Q96L92 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SNX27Q96L92 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SNX27Q96L92 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SNX27Q96L92 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SNX27Q96L92 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SNX27Q96L92 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SNX27Q96L92 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SNX27Q96L92 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SNX27Q96L92 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SNX27Q96L92 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SNX27Q96L92 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SNX27Q96L92 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SNX27Q96L92 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SNX27Q96L92 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SNX27Q96L92 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SNX27Q96L92 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SNX27Q96L92 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SNX27Q96L92 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SNX27Q96L92 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SNX27Q96L92 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SNX27Q96L92 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SNX27Q96L92 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SNX27Q96L92 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SNX27Q96L92 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SNX27Q96L92 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SNX27Q96L92 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SNX27Q96L92 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SNX27Q96L92 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SNX27Q96L92 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SNX27Q96L92 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SNX27Q96L92 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SNX27Q96L92 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms