Protein–RNA interactions for Protein: Q96JQ0

DCHS1, Protocadherin-16, humanhuman

Predictions only

Length 3,298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCHS1Q96JQ0 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
DCHS1Q96JQ0 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
DCHS1Q96JQ0 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
DCHS1Q96JQ0 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
DCHS1Q96JQ0 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
DCHS1Q96JQ0 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
DCHS1Q96JQ0 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
DCHS1Q96JQ0 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
DCHS1Q96JQ0 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
DCHS1Q96JQ0 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
DCHS1Q96JQ0 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
DCHS1Q96JQ0 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
DCHS1Q96JQ0 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
DCHS1Q96JQ0 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
DCHS1Q96JQ0 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
DCHS1Q96JQ0 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
DCHS1Q96JQ0 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
DCHS1Q96JQ0 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
DCHS1Q96JQ0 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
DCHS1Q96JQ0 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
DCHS1Q96JQ0 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.1■□□□□ 0.65
DCHS1Q96JQ0 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
DCHS1Q96JQ0 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
DCHS1Q96JQ0 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
DCHS1Q96JQ0 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
DCHS1Q96JQ0 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
DCHS1Q96JQ0 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
DCHS1Q96JQ0 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
DCHS1Q96JQ0 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
DCHS1Q96JQ0 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
DCHS1Q96JQ0 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
DCHS1Q96JQ0 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
DCHS1Q96JQ0 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
DCHS1Q96JQ0 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
DCHS1Q96JQ0 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
DCHS1Q96JQ0 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
DCHS1Q96JQ0 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
DCHS1Q96JQ0 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
DCHS1Q96JQ0 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
DCHS1Q96JQ0 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
DCHS1Q96JQ0 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
DCHS1Q96JQ0 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
DCHS1Q96JQ0 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
DCHS1Q96JQ0 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
DCHS1Q96JQ0 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
DCHS1Q96JQ0 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
DCHS1Q96JQ0 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
DCHS1Q96JQ0 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
DCHS1Q96JQ0 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
DCHS1Q96JQ0 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
DCHS1Q96JQ0 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
DCHS1Q96JQ0 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
DCHS1Q96JQ0 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
DCHS1Q96JQ0 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
DCHS1Q96JQ0 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
DCHS1Q96JQ0 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
DCHS1Q96JQ0 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
DCHS1Q96JQ0 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
DCHS1Q96JQ0 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
DCHS1Q96JQ0 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
DCHS1Q96JQ0 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
DCHS1Q96JQ0 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
DCHS1Q96JQ0 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
DCHS1Q96JQ0 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
DCHS1Q96JQ0 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
DCHS1Q96JQ0 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
DCHS1Q96JQ0 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.65
DCHS1Q96JQ0 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
DCHS1Q96JQ0 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
DCHS1Q96JQ0 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
DCHS1Q96JQ0 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
DCHS1Q96JQ0 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
DCHS1Q96JQ0 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
DCHS1Q96JQ0 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
DCHS1Q96JQ0 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
DCHS1Q96JQ0 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
DCHS1Q96JQ0 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
DCHS1Q96JQ0 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
DCHS1Q96JQ0 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
DCHS1Q96JQ0 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
DCHS1Q96JQ0 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
DCHS1Q96JQ0 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
DCHS1Q96JQ0 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
DCHS1Q96JQ0 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
DCHS1Q96JQ0 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
DCHS1Q96JQ0 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
DCHS1Q96JQ0 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
DCHS1Q96JQ0 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
DCHS1Q96JQ0 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
DCHS1Q96JQ0 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
DCHS1Q96JQ0 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
DCHS1Q96JQ0 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
DCHS1Q96JQ0 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
DCHS1Q96JQ0 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
DCHS1Q96JQ0 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
DCHS1Q96JQ0 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
DCHS1Q96JQ0 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
DCHS1Q96JQ0 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
DCHS1Q96JQ0 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
DCHS1Q96JQ0 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms