Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB5

CDK5RAP3, CDK5 regulatory subunit-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5RAP3Q96JB5 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDK5RAP3Q96JB5 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDK5RAP3Q96JB5 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDK5RAP3Q96JB5 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDK5RAP3Q96JB5 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDK5RAP3Q96JB5 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDK5RAP3Q96JB5 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDK5RAP3Q96JB5 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CDK5RAP3Q96JB5 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDK5RAP3Q96JB5 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDK5RAP3Q96JB5 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDK5RAP3Q96JB5 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDK5RAP3Q96JB5 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDK5RAP3Q96JB5 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDK5RAP3Q96JB5 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDK5RAP3Q96JB5 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDK5RAP3Q96JB5 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDK5RAP3Q96JB5 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDK5RAP3Q96JB5 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDK5RAP3Q96JB5 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDK5RAP3Q96JB5 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDK5RAP3Q96JB5 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDK5RAP3Q96JB5 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CDK5RAP3Q96JB5 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDK5RAP3Q96JB5 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDK5RAP3Q96JB5 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDK5RAP3Q96JB5 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDK5RAP3Q96JB5 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDK5RAP3Q96JB5 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDK5RAP3Q96JB5 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CDK5RAP3Q96JB5 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDK5RAP3Q96JB5 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDK5RAP3Q96JB5 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDK5RAP3Q96JB5 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDK5RAP3Q96JB5 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDK5RAP3Q96JB5 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDK5RAP3Q96JB5 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDK5RAP3Q96JB5 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDK5RAP3Q96JB5 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDK5RAP3Q96JB5 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDK5RAP3Q96JB5 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDK5RAP3Q96JB5 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDK5RAP3Q96JB5 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDK5RAP3Q96JB5 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDK5RAP3Q96JB5 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDK5RAP3Q96JB5 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDK5RAP3Q96JB5 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDK5RAP3Q96JB5 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDK5RAP3Q96JB5 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDK5RAP3Q96JB5 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CDK5RAP3Q96JB5 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDK5RAP3Q96JB5 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDK5RAP3Q96JB5 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDK5RAP3Q96JB5 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDK5RAP3Q96JB5 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDK5RAP3Q96JB5 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDK5RAP3Q96JB5 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CDK5RAP3Q96JB5 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDK5RAP3Q96JB5 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDK5RAP3Q96JB5 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDK5RAP3Q96JB5 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDK5RAP3Q96JB5 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDK5RAP3Q96JB5 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDK5RAP3Q96JB5 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDK5RAP3Q96JB5 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDK5RAP3Q96JB5 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDK5RAP3Q96JB5 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDK5RAP3Q96JB5 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDK5RAP3Q96JB5 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDK5RAP3Q96JB5 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDK5RAP3Q96JB5 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDK5RAP3Q96JB5 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDK5RAP3Q96JB5 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDK5RAP3Q96JB5 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDK5RAP3Q96JB5 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDK5RAP3Q96JB5 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDK5RAP3Q96JB5 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDK5RAP3Q96JB5 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CDK5RAP3Q96JB5 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDK5RAP3Q96JB5 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CDK5RAP3Q96JB5 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDK5RAP3Q96JB5 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDK5RAP3Q96JB5 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDK5RAP3Q96JB5 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDK5RAP3Q96JB5 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDK5RAP3Q96JB5 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDK5RAP3Q96JB5 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDK5RAP3Q96JB5 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDK5RAP3Q96JB5 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDK5RAP3Q96JB5 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDK5RAP3Q96JB5 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDK5RAP3Q96JB5 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDK5RAP3Q96JB5 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDK5RAP3Q96JB5 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDK5RAP3Q96JB5 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDK5RAP3Q96JB5 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDK5RAP3Q96JB5 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDK5RAP3Q96JB5 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDK5RAP3Q96JB5 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDK5RAP3Q96JB5 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms