Protein–RNA interactions for Protein: Q96HJ3

CCDC34, Coiled-coil domain-containing protein 34, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC34Q96HJ3 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC34Q96HJ3 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC34Q96HJ3 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC34Q96HJ3 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC34Q96HJ3 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC34Q96HJ3 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC34Q96HJ3 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC34Q96HJ3 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC34Q96HJ3 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC34Q96HJ3 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC34Q96HJ3 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC34Q96HJ3 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC34Q96HJ3 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC34Q96HJ3 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC34Q96HJ3 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC34Q96HJ3 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC34Q96HJ3 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC34Q96HJ3 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC34Q96HJ3 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC34Q96HJ3 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CCDC34Q96HJ3 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC34Q96HJ3 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC34Q96HJ3 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC34Q96HJ3 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC34Q96HJ3 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC34Q96HJ3 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC34Q96HJ3 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC34Q96HJ3 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC34Q96HJ3 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC34Q96HJ3 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC34Q96HJ3 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC34Q96HJ3 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC34Q96HJ3 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC34Q96HJ3 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC34Q96HJ3 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC34Q96HJ3 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC34Q96HJ3 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC34Q96HJ3 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC34Q96HJ3 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC34Q96HJ3 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC34Q96HJ3 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC34Q96HJ3 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC34Q96HJ3 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC34Q96HJ3 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC34Q96HJ3 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CCDC34Q96HJ3 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC34Q96HJ3 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC34Q96HJ3 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC34Q96HJ3 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC34Q96HJ3 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC34Q96HJ3 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC34Q96HJ3 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC34Q96HJ3 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC34Q96HJ3 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC34Q96HJ3 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC34Q96HJ3 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC34Q96HJ3 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC34Q96HJ3 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC34Q96HJ3 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC34Q96HJ3 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC34Q96HJ3 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC34Q96HJ3 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CCDC34Q96HJ3 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CCDC34Q96HJ3 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CCDC34Q96HJ3 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CCDC34Q96HJ3 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CCDC34Q96HJ3 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC34Q96HJ3 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC34Q96HJ3 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC34Q96HJ3 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC34Q96HJ3 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC34Q96HJ3 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC34Q96HJ3 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC34Q96HJ3 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC34Q96HJ3 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC34Q96HJ3 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC34Q96HJ3 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC34Q96HJ3 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC34Q96HJ3 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC34Q96HJ3 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC34Q96HJ3 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC34Q96HJ3 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC34Q96HJ3 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC34Q96HJ3 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC34Q96HJ3 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC34Q96HJ3 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC34Q96HJ3 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC34Q96HJ3 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CCDC34Q96HJ3 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC34Q96HJ3 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC34Q96HJ3 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC34Q96HJ3 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC34Q96HJ3 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC34Q96HJ3 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC34Q96HJ3 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC34Q96HJ3 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC34Q96HJ3 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC34Q96HJ3 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC34Q96HJ3 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CCDC34Q96HJ3 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms