Protein–RNA interactions for Protein: Q96GF1

RNF185, E3 ubiquitin-protein ligase RNF185, humanhuman

Predictions only

Length 192 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF185Q96GF1 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
RNF185Q96GF1 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
RNF185Q96GF1 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
RNF185Q96GF1 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
RNF185Q96GF1 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
RNF185Q96GF1 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
RNF185Q96GF1 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
RNF185Q96GF1 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
RNF185Q96GF1 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
RNF185Q96GF1 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
RNF185Q96GF1 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
RNF185Q96GF1 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
RNF185Q96GF1 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
RNF185Q96GF1 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
RNF185Q96GF1 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
RNF185Q96GF1 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
RNF185Q96GF1 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
RNF185Q96GF1 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
RNF185Q96GF1 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
RNF185Q96GF1 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
RNF185Q96GF1 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
RNF185Q96GF1 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
RNF185Q96GF1 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
RNF185Q96GF1 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
RNF185Q96GF1 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
RNF185Q96GF1 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
RNF185Q96GF1 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
RNF185Q96GF1 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
RNF185Q96GF1 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
RNF185Q96GF1 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
RNF185Q96GF1 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
RNF185Q96GF1 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
RNF185Q96GF1 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
RNF185Q96GF1 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
RNF185Q96GF1 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
RNF185Q96GF1 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
RNF185Q96GF1 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
RNF185Q96GF1 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
RNF185Q96GF1 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
RNF185Q96GF1 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
RNF185Q96GF1 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
RNF185Q96GF1 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
RNF185Q96GF1 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
RNF185Q96GF1 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
RNF185Q96GF1 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
RNF185Q96GF1 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
RNF185Q96GF1 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
RNF185Q96GF1 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
RNF185Q96GF1 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
RNF185Q96GF1 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
RNF185Q96GF1 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
RNF185Q96GF1 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
RNF185Q96GF1 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
RNF185Q96GF1 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
RNF185Q96GF1 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
RNF185Q96GF1 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
RNF185Q96GF1 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
RNF185Q96GF1 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
RNF185Q96GF1 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
RNF185Q96GF1 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
RNF185Q96GF1 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
RNF185Q96GF1 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
RNF185Q96GF1 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
RNF185Q96GF1 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
RNF185Q96GF1 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
RNF185Q96GF1 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
RNF185Q96GF1 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
RNF185Q96GF1 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
RNF185Q96GF1 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
RNF185Q96GF1 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
RNF185Q96GF1 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
RNF185Q96GF1 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
RNF185Q96GF1 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
RNF185Q96GF1 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
RNF185Q96GF1 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
RNF185Q96GF1 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
RNF185Q96GF1 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
RNF185Q96GF1 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
RNF185Q96GF1 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
RNF185Q96GF1 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
RNF185Q96GF1 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
RNF185Q96GF1 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
RNF185Q96GF1 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
RNF185Q96GF1 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
RNF185Q96GF1 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
RNF185Q96GF1 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
RNF185Q96GF1 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
RNF185Q96GF1 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
RNF185Q96GF1 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
RNF185Q96GF1 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
RNF185Q96GF1 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
RNF185Q96GF1 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
RNF185Q96GF1 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
RNF185Q96GF1 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
RNF185Q96GF1 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
RNF185Q96GF1 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
RNF185Q96GF1 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
RNF185Q96GF1 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
RNF185Q96GF1 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
RNF185Q96GF1 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms