Protein–RNA interactions for Protein: Q96GD3

SCMH1, Polycomb protein SCMH1, humanhuman

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCMH1Q96GD3 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SCMH1Q96GD3 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SCMH1Q96GD3 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SCMH1Q96GD3 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SCMH1Q96GD3 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SCMH1Q96GD3 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SCMH1Q96GD3 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SCMH1Q96GD3 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SCMH1Q96GD3 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SCMH1Q96GD3 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SCMH1Q96GD3 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SCMH1Q96GD3 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SCMH1Q96GD3 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SCMH1Q96GD3 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
SCMH1Q96GD3 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SCMH1Q96GD3 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SCMH1Q96GD3 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SCMH1Q96GD3 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SCMH1Q96GD3 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SCMH1Q96GD3 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SCMH1Q96GD3 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SCMH1Q96GD3 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SCMH1Q96GD3 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SCMH1Q96GD3 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SCMH1Q96GD3 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SCMH1Q96GD3 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SCMH1Q96GD3 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SCMH1Q96GD3 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SCMH1Q96GD3 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SCMH1Q96GD3 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SCMH1Q96GD3 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SCMH1Q96GD3 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SCMH1Q96GD3 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SCMH1Q96GD3 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SCMH1Q96GD3 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SCMH1Q96GD3 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SCMH1Q96GD3 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SCMH1Q96GD3 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SCMH1Q96GD3 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SCMH1Q96GD3 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
SCMH1Q96GD3 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SCMH1Q96GD3 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SCMH1Q96GD3 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SCMH1Q96GD3 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SCMH1Q96GD3 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SCMH1Q96GD3 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SCMH1Q96GD3 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SCMH1Q96GD3 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SCMH1Q96GD3 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SCMH1Q96GD3 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SCMH1Q96GD3 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SCMH1Q96GD3 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SCMH1Q96GD3 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
SCMH1Q96GD3 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SCMH1Q96GD3 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
SCMH1Q96GD3 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SCMH1Q96GD3 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SCMH1Q96GD3 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
SCMH1Q96GD3 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SCMH1Q96GD3 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
SCMH1Q96GD3 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SCMH1Q96GD3 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SCMH1Q96GD3 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SCMH1Q96GD3 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SCMH1Q96GD3 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SCMH1Q96GD3 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SCMH1Q96GD3 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SCMH1Q96GD3 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SCMH1Q96GD3 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SCMH1Q96GD3 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SCMH1Q96GD3 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SCMH1Q96GD3 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SCMH1Q96GD3 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SCMH1Q96GD3 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
SCMH1Q96GD3 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SCMH1Q96GD3 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SCMH1Q96GD3 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SCMH1Q96GD3 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SCMH1Q96GD3 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SCMH1Q96GD3 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SCMH1Q96GD3 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SCMH1Q96GD3 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SCMH1Q96GD3 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SCMH1Q96GD3 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SCMH1Q96GD3 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SCMH1Q96GD3 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SCMH1Q96GD3 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
SCMH1Q96GD3 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SCMH1Q96GD3 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
SCMH1Q96GD3 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SCMH1Q96GD3 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
SCMH1Q96GD3 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SCMH1Q96GD3 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SCMH1Q96GD3 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SCMH1Q96GD3 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SCMH1Q96GD3 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SCMH1Q96GD3 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SCMH1Q96GD3 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SCMH1Q96GD3 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SCMH1Q96GD3 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms