Protein–RNA interactions for Protein: Q96G79

SLC35A4, Probable UDP-sugar transporter protein SLC35A4, humanhuman

Predictions only

Length 324 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC35A4Q96G79 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC35A4Q96G79 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC35A4Q96G79 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC35A4Q96G79 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC35A4Q96G79 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC35A4Q96G79 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC35A4Q96G79 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC35A4Q96G79 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC35A4Q96G79 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC35A4Q96G79 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC35A4Q96G79 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC35A4Q96G79 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC35A4Q96G79 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC35A4Q96G79 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC35A4Q96G79 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC35A4Q96G79 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC35A4Q96G79 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC35A4Q96G79 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC35A4Q96G79 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC35A4Q96G79 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC35A4Q96G79 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC35A4Q96G79 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC35A4Q96G79 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC35A4Q96G79 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC35A4Q96G79 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC35A4Q96G79 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC35A4Q96G79 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC35A4Q96G79 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC35A4Q96G79 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC35A4Q96G79 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC35A4Q96G79 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC35A4Q96G79 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC35A4Q96G79 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC35A4Q96G79 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC35A4Q96G79 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC35A4Q96G79 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC35A4Q96G79 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC35A4Q96G79 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC35A4Q96G79 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC35A4Q96G79 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC35A4Q96G79 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC35A4Q96G79 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC35A4Q96G79 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC35A4Q96G79 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC35A4Q96G79 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC35A4Q96G79 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC35A4Q96G79 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC35A4Q96G79 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC35A4Q96G79 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC35A4Q96G79 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC35A4Q96G79 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC35A4Q96G79 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC35A4Q96G79 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC35A4Q96G79 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC35A4Q96G79 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC35A4Q96G79 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC35A4Q96G79 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC35A4Q96G79 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC35A4Q96G79 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC35A4Q96G79 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC35A4Q96G79 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC35A4Q96G79 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC35A4Q96G79 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC35A4Q96G79 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC35A4Q96G79 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC35A4Q96G79 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC35A4Q96G79 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC35A4Q96G79 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC35A4Q96G79 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC35A4Q96G79 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC35A4Q96G79 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC35A4Q96G79 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC35A4Q96G79 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC35A4Q96G79 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC35A4Q96G79 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC35A4Q96G79 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC35A4Q96G79 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC35A4Q96G79 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC35A4Q96G79 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC35A4Q96G79 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC35A4Q96G79 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC35A4Q96G79 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC35A4Q96G79 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC35A4Q96G79 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC35A4Q96G79 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC35A4Q96G79 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC35A4Q96G79 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC35A4Q96G79 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC35A4Q96G79 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC35A4Q96G79 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC35A4Q96G79 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC35A4Q96G79 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC35A4Q96G79 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC35A4Q96G79 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC35A4Q96G79 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC35A4Q96G79 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC35A4Q96G79 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC35A4Q96G79 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC35A4Q96G79 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC35A4Q96G79 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms