Protein–RNA interactions for Protein: Q96EY1

DNAJA3, DnaJ homolog subfamily A member 3, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJA3Q96EY1 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
DNAJA3Q96EY1 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
DNAJA3Q96EY1 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
DNAJA3Q96EY1 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
DNAJA3Q96EY1 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
DNAJA3Q96EY1 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
DNAJA3Q96EY1 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
DNAJA3Q96EY1 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
DNAJA3Q96EY1 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
DNAJA3Q96EY1 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
DNAJA3Q96EY1 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
DNAJA3Q96EY1 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DNAJA3Q96EY1 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DNAJA3Q96EY1 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
DNAJA3Q96EY1 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
DNAJA3Q96EY1 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DNAJA3Q96EY1 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DNAJA3Q96EY1 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DNAJA3Q96EY1 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
DNAJA3Q96EY1 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DNAJA3Q96EY1 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DNAJA3Q96EY1 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DNAJA3Q96EY1 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
DNAJA3Q96EY1 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DNAJA3Q96EY1 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
DNAJA3Q96EY1 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DNAJA3Q96EY1 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
DNAJA3Q96EY1 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
DNAJA3Q96EY1 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
DNAJA3Q96EY1 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
DNAJA3Q96EY1 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
DNAJA3Q96EY1 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
DNAJA3Q96EY1 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
DNAJA3Q96EY1 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
DNAJA3Q96EY1 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DNAJA3Q96EY1 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DNAJA3Q96EY1 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DNAJA3Q96EY1 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
DNAJA3Q96EY1 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
DNAJA3Q96EY1 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DNAJA3Q96EY1 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
DNAJA3Q96EY1 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DNAJA3Q96EY1 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DNAJA3Q96EY1 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DNAJA3Q96EY1 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DNAJA3Q96EY1 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
DNAJA3Q96EY1 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
DNAJA3Q96EY1 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DNAJA3Q96EY1 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DNAJA3Q96EY1 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DNAJA3Q96EY1 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
DNAJA3Q96EY1 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
DNAJA3Q96EY1 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DNAJA3Q96EY1 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DNAJA3Q96EY1 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DNAJA3Q96EY1 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
DNAJA3Q96EY1 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DNAJA3Q96EY1 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
DNAJA3Q96EY1 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
DNAJA3Q96EY1 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
DNAJA3Q96EY1 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
DNAJA3Q96EY1 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
DNAJA3Q96EY1 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
DNAJA3Q96EY1 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
DNAJA3Q96EY1 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DNAJA3Q96EY1 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DNAJA3Q96EY1 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DNAJA3Q96EY1 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DNAJA3Q96EY1 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
DNAJA3Q96EY1 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
DNAJA3Q96EY1 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DNAJA3Q96EY1 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DNAJA3Q96EY1 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DNAJA3Q96EY1 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
DNAJA3Q96EY1 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DNAJA3Q96EY1 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
DNAJA3Q96EY1 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
DNAJA3Q96EY1 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DNAJA3Q96EY1 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DNAJA3Q96EY1 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DNAJA3Q96EY1 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
DNAJA3Q96EY1 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DNAJA3Q96EY1 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DNAJA3Q96EY1 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
DNAJA3Q96EY1 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
DNAJA3Q96EY1 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DNAJA3Q96EY1 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DNAJA3Q96EY1 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DNAJA3Q96EY1 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DNAJA3Q96EY1 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DNAJA3Q96EY1 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
DNAJA3Q96EY1 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DNAJA3Q96EY1 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DNAJA3Q96EY1 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DNAJA3Q96EY1 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DNAJA3Q96EY1 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
DNAJA3Q96EY1 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DNAJA3Q96EY1 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DNAJA3Q96EY1 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
DNAJA3Q96EY1 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms