Protein–RNA interactions for Protein: Q96EX1

SMIM12, Small integral membrane protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM12Q96EX1 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMIM12Q96EX1 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMIM12Q96EX1 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMIM12Q96EX1 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMIM12Q96EX1 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
SMIM12Q96EX1 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMIM12Q96EX1 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMIM12Q96EX1 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMIM12Q96EX1 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMIM12Q96EX1 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
SMIM12Q96EX1 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SMIM12Q96EX1 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SMIM12Q96EX1 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SMIM12Q96EX1 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SMIM12Q96EX1 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SMIM12Q96EX1 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
SMIM12Q96EX1 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
SMIM12Q96EX1 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SMIM12Q96EX1 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SMIM12Q96EX1 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SMIM12Q96EX1 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SMIM12Q96EX1 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SMIM12Q96EX1 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SMIM12Q96EX1 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SMIM12Q96EX1 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SMIM12Q96EX1 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
SMIM12Q96EX1 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SMIM12Q96EX1 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SMIM12Q96EX1 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SMIM12Q96EX1 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SMIM12Q96EX1 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SMIM12Q96EX1 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SMIM12Q96EX1 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SMIM12Q96EX1 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SMIM12Q96EX1 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SMIM12Q96EX1 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SMIM12Q96EX1 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SMIM12Q96EX1 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SMIM12Q96EX1 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SMIM12Q96EX1 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SMIM12Q96EX1 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SMIM12Q96EX1 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC15.08■□□□□ 0
SMIM12Q96EX1 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SMIM12Q96EX1 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
SMIM12Q96EX1 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
SMIM12Q96EX1 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
SMIM12Q96EX1 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SMIM12Q96EX1 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SMIM12Q96EX1 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SMIM12Q96EX1 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SMIM12Q96EX1 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SMIM12Q96EX1 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SMIM12Q96EX1 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SMIM12Q96EX1 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SMIM12Q96EX1 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SMIM12Q96EX1 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SMIM12Q96EX1 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SMIM12Q96EX1 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SMIM12Q96EX1 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SMIM12Q96EX1 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SMIM12Q96EX1 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SMIM12Q96EX1 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SMIM12Q96EX1 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SMIM12Q96EX1 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SMIM12Q96EX1 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
SMIM12Q96EX1 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SMIM12Q96EX1 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
SMIM12Q96EX1 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
SMIM12Q96EX1 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SMIM12Q96EX1 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SMIM12Q96EX1 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SMIM12Q96EX1 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC15.07■□□□□ 0
SMIM12Q96EX1 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SMIM12Q96EX1 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SMIM12Q96EX1 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
SMIM12Q96EX1 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SMIM12Q96EX1 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SMIM12Q96EX1 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
SMIM12Q96EX1 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
SMIM12Q96EX1 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SMIM12Q96EX1 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SMIM12Q96EX1 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SMIM12Q96EX1 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SMIM12Q96EX1 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SMIM12Q96EX1 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SMIM12Q96EX1 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SMIM12Q96EX1 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SMIM12Q96EX1 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SMIM12Q96EX1 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SMIM12Q96EX1 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SMIM12Q96EX1 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SMIM12Q96EX1 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SMIM12Q96EX1 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
SMIM12Q96EX1 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SMIM12Q96EX1 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SMIM12Q96EX1 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SMIM12Q96EX1 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
SMIM12Q96EX1 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC15.06■□□□□ 0
SMIM12Q96EX1 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
SMIM12Q96EX1 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms