Protein–RNA interactions for Protein: Q96CM4

NXNL1, Nucleoredoxin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NXNL1Q96CM4 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
NXNL1Q96CM4 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
NXNL1Q96CM4 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
NXNL1Q96CM4 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
NXNL1Q96CM4 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
NXNL1Q96CM4 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
NXNL1Q96CM4 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
NXNL1Q96CM4 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
NXNL1Q96CM4 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
NXNL1Q96CM4 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
NXNL1Q96CM4 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
NXNL1Q96CM4 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
NXNL1Q96CM4 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
NXNL1Q96CM4 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
NXNL1Q96CM4 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
NXNL1Q96CM4 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
NXNL1Q96CM4 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
NXNL1Q96CM4 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
NXNL1Q96CM4 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
NXNL1Q96CM4 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
NXNL1Q96CM4 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NXNL1Q96CM4 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
NXNL1Q96CM4 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
NXNL1Q96CM4 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NXNL1Q96CM4 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NXNL1Q96CM4 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
NXNL1Q96CM4 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NXNL1Q96CM4 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NXNL1Q96CM4 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NXNL1Q96CM4 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
NXNL1Q96CM4 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
NXNL1Q96CM4 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
NXNL1Q96CM4 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
NXNL1Q96CM4 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NXNL1Q96CM4 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NXNL1Q96CM4 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NXNL1Q96CM4 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NXNL1Q96CM4 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
NXNL1Q96CM4 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NXNL1Q96CM4 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
NXNL1Q96CM4 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
NXNL1Q96CM4 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
NXNL1Q96CM4 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
NXNL1Q96CM4 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
NXNL1Q96CM4 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
NXNL1Q96CM4 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
NXNL1Q96CM4 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
NXNL1Q96CM4 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
NXNL1Q96CM4 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
NXNL1Q96CM4 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
NXNL1Q96CM4 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
NXNL1Q96CM4 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
NXNL1Q96CM4 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
NXNL1Q96CM4 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
NXNL1Q96CM4 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
NXNL1Q96CM4 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
NXNL1Q96CM4 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
NXNL1Q96CM4 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
NXNL1Q96CM4 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
NXNL1Q96CM4 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC19.58■□□□□ 0.72
NXNL1Q96CM4 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
NXNL1Q96CM4 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NXNL1Q96CM4 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
NXNL1Q96CM4 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
NXNL1Q96CM4 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NXNL1Q96CM4 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
NXNL1Q96CM4 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NXNL1Q96CM4 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NXNL1Q96CM4 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
NXNL1Q96CM4 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NXNL1Q96CM4 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
NXNL1Q96CM4 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
NXNL1Q96CM4 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
NXNL1Q96CM4 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NXNL1Q96CM4 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
NXNL1Q96CM4 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC19.57■□□□□ 0.72
NXNL1Q96CM4 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
NXNL1Q96CM4 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NXNL1Q96CM4 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NXNL1Q96CM4 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
NXNL1Q96CM4 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NXNL1Q96CM4 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NXNL1Q96CM4 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
NXNL1Q96CM4 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
NXNL1Q96CM4 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
NXNL1Q96CM4 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NXNL1Q96CM4 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NXNL1Q96CM4 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
NXNL1Q96CM4 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
NXNL1Q96CM4 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NXNL1Q96CM4 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
NXNL1Q96CM4 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
NXNL1Q96CM4 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NXNL1Q96CM4 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NXNL1Q96CM4 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NXNL1Q96CM4 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
NXNL1Q96CM4 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
NXNL1Q96CM4 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
NXNL1Q96CM4 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
NXNL1Q96CM4 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms