Protein–RNA interactions for Protein: Q96BQ1

FAM3D, Protein FAM3D, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3DQ96BQ1 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
FAM3DQ96BQ1 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FAM3DQ96BQ1 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FAM3DQ96BQ1 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
FAM3DQ96BQ1 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FAM3DQ96BQ1 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FAM3DQ96BQ1 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FAM3DQ96BQ1 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
FAM3DQ96BQ1 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
FAM3DQ96BQ1 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
FAM3DQ96BQ1 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
FAM3DQ96BQ1 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
FAM3DQ96BQ1 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
FAM3DQ96BQ1 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
FAM3DQ96BQ1 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
FAM3DQ96BQ1 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
FAM3DQ96BQ1 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
FAM3DQ96BQ1 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
FAM3DQ96BQ1 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
FAM3DQ96BQ1 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
FAM3DQ96BQ1 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
FAM3DQ96BQ1 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
FAM3DQ96BQ1 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
FAM3DQ96BQ1 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
FAM3DQ96BQ1 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
FAM3DQ96BQ1 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
FAM3DQ96BQ1 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
FAM3DQ96BQ1 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
FAM3DQ96BQ1 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
FAM3DQ96BQ1 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
FAM3DQ96BQ1 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
FAM3DQ96BQ1 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
FAM3DQ96BQ1 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
FAM3DQ96BQ1 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
FAM3DQ96BQ1 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
FAM3DQ96BQ1 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
FAM3DQ96BQ1 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
FAM3DQ96BQ1 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
FAM3DQ96BQ1 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
FAM3DQ96BQ1 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
FAM3DQ96BQ1 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
FAM3DQ96BQ1 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
FAM3DQ96BQ1 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
FAM3DQ96BQ1 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
FAM3DQ96BQ1 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
FAM3DQ96BQ1 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
FAM3DQ96BQ1 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
FAM3DQ96BQ1 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
FAM3DQ96BQ1 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
FAM3DQ96BQ1 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
FAM3DQ96BQ1 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
FAM3DQ96BQ1 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
FAM3DQ96BQ1 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
FAM3DQ96BQ1 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
FAM3DQ96BQ1 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
FAM3DQ96BQ1 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
FAM3DQ96BQ1 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
FAM3DQ96BQ1 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
FAM3DQ96BQ1 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
FAM3DQ96BQ1 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
FAM3DQ96BQ1 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
FAM3DQ96BQ1 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
FAM3DQ96BQ1 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
FAM3DQ96BQ1 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
FAM3DQ96BQ1 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
FAM3DQ96BQ1 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
FAM3DQ96BQ1 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
FAM3DQ96BQ1 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
FAM3DQ96BQ1 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
FAM3DQ96BQ1 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
FAM3DQ96BQ1 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
FAM3DQ96BQ1 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
FAM3DQ96BQ1 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
FAM3DQ96BQ1 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
FAM3DQ96BQ1 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
FAM3DQ96BQ1 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
FAM3DQ96BQ1 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
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FAM3DQ96BQ1 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
FAM3DQ96BQ1 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
FAM3DQ96BQ1 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
FAM3DQ96BQ1 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
FAM3DQ96BQ1 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
FAM3DQ96BQ1 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
FAM3DQ96BQ1 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
FAM3DQ96BQ1 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
FAM3DQ96BQ1 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
FAM3DQ96BQ1 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
FAM3DQ96BQ1 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
FAM3DQ96BQ1 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
FAM3DQ96BQ1 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
FAM3DQ96BQ1 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
FAM3DQ96BQ1 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
FAM3DQ96BQ1 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
FAM3DQ96BQ1 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
FAM3DQ96BQ1 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
FAM3DQ96BQ1 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
FAM3DQ96BQ1 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
FAM3DQ96BQ1 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
FAM3DQ96BQ1 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
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