Protein–RNA interactions for Protein: Q969G5

CAVIN3, Caveolae-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAVIN3Q969G5 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CAVIN3Q969G5 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CAVIN3Q969G5 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CAVIN3Q969G5 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CAVIN3Q969G5 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CAVIN3Q969G5 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CAVIN3Q969G5 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CAVIN3Q969G5 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CAVIN3Q969G5 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CAVIN3Q969G5 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CAVIN3Q969G5 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CAVIN3Q969G5 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CAVIN3Q969G5 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
CAVIN3Q969G5 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CAVIN3Q969G5 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CAVIN3Q969G5 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CAVIN3Q969G5 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CAVIN3Q969G5 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CAVIN3Q969G5 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CAVIN3Q969G5 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CAVIN3Q969G5 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CAVIN3Q969G5 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CAVIN3Q969G5 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CAVIN3Q969G5 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CAVIN3Q969G5 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CAVIN3Q969G5 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CAVIN3Q969G5 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CAVIN3Q969G5 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CAVIN3Q969G5 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CAVIN3Q969G5 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CAVIN3Q969G5 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CAVIN3Q969G5 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CAVIN3Q969G5 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
CAVIN3Q969G5 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CAVIN3Q969G5 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CAVIN3Q969G5 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CAVIN3Q969G5 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CAVIN3Q969G5 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CAVIN3Q969G5 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CAVIN3Q969G5 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CAVIN3Q969G5 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
CAVIN3Q969G5 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CAVIN3Q969G5 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
CAVIN3Q969G5 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CAVIN3Q969G5 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CAVIN3Q969G5 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CAVIN3Q969G5 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CAVIN3Q969G5 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CAVIN3Q969G5 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CAVIN3Q969G5 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CAVIN3Q969G5 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CAVIN3Q969G5 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CAVIN3Q969G5 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CAVIN3Q969G5 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CAVIN3Q969G5 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CAVIN3Q969G5 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CAVIN3Q969G5 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CAVIN3Q969G5 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CAVIN3Q969G5 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CAVIN3Q969G5 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
CAVIN3Q969G5 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CAVIN3Q969G5 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CAVIN3Q969G5 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CAVIN3Q969G5 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CAVIN3Q969G5 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CAVIN3Q969G5 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
CAVIN3Q969G5 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CAVIN3Q969G5 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
CAVIN3Q969G5 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CAVIN3Q969G5 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CAVIN3Q969G5 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CAVIN3Q969G5 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CAVIN3Q969G5 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CAVIN3Q969G5 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
CAVIN3Q969G5 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CAVIN3Q969G5 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CAVIN3Q969G5 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CAVIN3Q969G5 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CAVIN3Q969G5 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
CAVIN3Q969G5 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
CAVIN3Q969G5 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CAVIN3Q969G5 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
CAVIN3Q969G5 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CAVIN3Q969G5 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CAVIN3Q969G5 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
CAVIN3Q969G5 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CAVIN3Q969G5 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CAVIN3Q969G5 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CAVIN3Q969G5 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CAVIN3Q969G5 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CAVIN3Q969G5 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CAVIN3Q969G5 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CAVIN3Q969G5 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CAVIN3Q969G5 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
CAVIN3Q969G5 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CAVIN3Q969G5 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CAVIN3Q969G5 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CAVIN3Q969G5 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CAVIN3Q969G5 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CAVIN3Q969G5 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms