Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXC6

COPS9, COP9 signalosome complex subunit 9, humanhuman

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Length 57 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS9Q8WXC6 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
COPS9Q8WXC6 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
COPS9Q8WXC6 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
COPS9Q8WXC6 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
COPS9Q8WXC6 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
COPS9Q8WXC6 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
COPS9Q8WXC6 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
COPS9Q8WXC6 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
COPS9Q8WXC6 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
COPS9Q8WXC6 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
COPS9Q8WXC6 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
COPS9Q8WXC6 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
COPS9Q8WXC6 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
COPS9Q8WXC6 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
COPS9Q8WXC6 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
COPS9Q8WXC6 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
COPS9Q8WXC6 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
COPS9Q8WXC6 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
COPS9Q8WXC6 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
COPS9Q8WXC6 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
COPS9Q8WXC6 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
COPS9Q8WXC6 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
COPS9Q8WXC6 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
COPS9Q8WXC6 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
COPS9Q8WXC6 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
COPS9Q8WXC6 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
COPS9Q8WXC6 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
COPS9Q8WXC6 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
COPS9Q8WXC6 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
COPS9Q8WXC6 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
COPS9Q8WXC6 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
COPS9Q8WXC6 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
COPS9Q8WXC6 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
COPS9Q8WXC6 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
COPS9Q8WXC6 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
COPS9Q8WXC6 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
COPS9Q8WXC6 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
COPS9Q8WXC6 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
COPS9Q8WXC6 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
COPS9Q8WXC6 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
COPS9Q8WXC6 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
COPS9Q8WXC6 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
COPS9Q8WXC6 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
COPS9Q8WXC6 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
COPS9Q8WXC6 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
COPS9Q8WXC6 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
COPS9Q8WXC6 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
COPS9Q8WXC6 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
COPS9Q8WXC6 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
COPS9Q8WXC6 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
COPS9Q8WXC6 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
COPS9Q8WXC6 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
COPS9Q8WXC6 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
COPS9Q8WXC6 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
COPS9Q8WXC6 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
COPS9Q8WXC6 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
COPS9Q8WXC6 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
COPS9Q8WXC6 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
COPS9Q8WXC6 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
COPS9Q8WXC6 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
COPS9Q8WXC6 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
COPS9Q8WXC6 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
COPS9Q8WXC6 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
COPS9Q8WXC6 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
COPS9Q8WXC6 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
COPS9Q8WXC6 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
COPS9Q8WXC6 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
COPS9Q8WXC6 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
COPS9Q8WXC6 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
COPS9Q8WXC6 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
COPS9Q8WXC6 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
COPS9Q8WXC6 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
COPS9Q8WXC6 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
COPS9Q8WXC6 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
COPS9Q8WXC6 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
COPS9Q8WXC6 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
COPS9Q8WXC6 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
COPS9Q8WXC6 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
COPS9Q8WXC6 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
COPS9Q8WXC6 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
COPS9Q8WXC6 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
COPS9Q8WXC6 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
COPS9Q8WXC6 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.27
COPS9Q8WXC6 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
COPS9Q8WXC6 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
COPS9Q8WXC6 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
COPS9Q8WXC6 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
COPS9Q8WXC6 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
COPS9Q8WXC6 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
COPS9Q8WXC6 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
COPS9Q8WXC6 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
COPS9Q8WXC6 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
COPS9Q8WXC6 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
COPS9Q8WXC6 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
COPS9Q8WXC6 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
COPS9Q8WXC6 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
COPS9Q8WXC6 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
COPS9Q8WXC6 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
COPS9Q8WXC6 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
COPS9Q8WXC6 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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