Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV16

DCAF4, DDB1- and CUL4-associated factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCAF4Q8WV16 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
DCAF4Q8WV16 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
DCAF4Q8WV16 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
DCAF4Q8WV16 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
DCAF4Q8WV16 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
DCAF4Q8WV16 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
DCAF4Q8WV16 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
DCAF4Q8WV16 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
DCAF4Q8WV16 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
DCAF4Q8WV16 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
DCAF4Q8WV16 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
DCAF4Q8WV16 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
DCAF4Q8WV16 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
DCAF4Q8WV16 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
DCAF4Q8WV16 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
DCAF4Q8WV16 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
DCAF4Q8WV16 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
DCAF4Q8WV16 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
DCAF4Q8WV16 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
DCAF4Q8WV16 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
DCAF4Q8WV16 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
DCAF4Q8WV16 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
DCAF4Q8WV16 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
DCAF4Q8WV16 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
DCAF4Q8WV16 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
DCAF4Q8WV16 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
DCAF4Q8WV16 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
DCAF4Q8WV16 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
DCAF4Q8WV16 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
DCAF4Q8WV16 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
DCAF4Q8WV16 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
DCAF4Q8WV16 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
DCAF4Q8WV16 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
DCAF4Q8WV16 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
DCAF4Q8WV16 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
DCAF4Q8WV16 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
DCAF4Q8WV16 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
DCAF4Q8WV16 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
DCAF4Q8WV16 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
DCAF4Q8WV16 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
DCAF4Q8WV16 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
DCAF4Q8WV16 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
DCAF4Q8WV16 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
DCAF4Q8WV16 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
DCAF4Q8WV16 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
DCAF4Q8WV16 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
DCAF4Q8WV16 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
DCAF4Q8WV16 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
DCAF4Q8WV16 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
DCAF4Q8WV16 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
DCAF4Q8WV16 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
DCAF4Q8WV16 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
DCAF4Q8WV16 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
DCAF4Q8WV16 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
DCAF4Q8WV16 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
DCAF4Q8WV16 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
DCAF4Q8WV16 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
DCAF4Q8WV16 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
DCAF4Q8WV16 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
DCAF4Q8WV16 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
DCAF4Q8WV16 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
DCAF4Q8WV16 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
DCAF4Q8WV16 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
DCAF4Q8WV16 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
DCAF4Q8WV16 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
DCAF4Q8WV16 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
DCAF4Q8WV16 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
DCAF4Q8WV16 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
DCAF4Q8WV16 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
DCAF4Q8WV16 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
DCAF4Q8WV16 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
DCAF4Q8WV16 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
DCAF4Q8WV16 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
DCAF4Q8WV16 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
DCAF4Q8WV16 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
DCAF4Q8WV16 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
DCAF4Q8WV16 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
DCAF4Q8WV16 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
DCAF4Q8WV16 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
DCAF4Q8WV16 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
DCAF4Q8WV16 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
DCAF4Q8WV16 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
DCAF4Q8WV16 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
DCAF4Q8WV16 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
DCAF4Q8WV16 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
DCAF4Q8WV16 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
DCAF4Q8WV16 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
DCAF4Q8WV16 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
DCAF4Q8WV16 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
DCAF4Q8WV16 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
DCAF4Q8WV16 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
DCAF4Q8WV16 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
DCAF4Q8WV16 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
DCAF4Q8WV16 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
DCAF4Q8WV16 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
DCAF4Q8WV16 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
DCAF4Q8WV16 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
DCAF4Q8WV16 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
DCAF4Q8WV16 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
DCAF4Q8WV16 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.1 ms