Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUR7

C15orf40, UPF0235 protein C15orf40, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C15orf40Q8WUR7 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
C15orf40Q8WUR7 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
C15orf40Q8WUR7 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
C15orf40Q8WUR7 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
C15orf40Q8WUR7 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
C15orf40Q8WUR7 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
C15orf40Q8WUR7 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
C15orf40Q8WUR7 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
C15orf40Q8WUR7 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
C15orf40Q8WUR7 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
C15orf40Q8WUR7 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
C15orf40Q8WUR7 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
C15orf40Q8WUR7 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
C15orf40Q8WUR7 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
C15orf40Q8WUR7 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
C15orf40Q8WUR7 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
C15orf40Q8WUR7 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
C15orf40Q8WUR7 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
C15orf40Q8WUR7 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
C15orf40Q8WUR7 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
C15orf40Q8WUR7 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
C15orf40Q8WUR7 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
C15orf40Q8WUR7 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
C15orf40Q8WUR7 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
C15orf40Q8WUR7 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
C15orf40Q8WUR7 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
C15orf40Q8WUR7 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
C15orf40Q8WUR7 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
C15orf40Q8WUR7 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
C15orf40Q8WUR7 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
C15orf40Q8WUR7 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
C15orf40Q8WUR7 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
C15orf40Q8WUR7 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
C15orf40Q8WUR7 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
C15orf40Q8WUR7 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
C15orf40Q8WUR7 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
C15orf40Q8WUR7 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
C15orf40Q8WUR7 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
C15orf40Q8WUR7 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
C15orf40Q8WUR7 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
C15orf40Q8WUR7 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
C15orf40Q8WUR7 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
C15orf40Q8WUR7 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
C15orf40Q8WUR7 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
C15orf40Q8WUR7 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
C15orf40Q8WUR7 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
C15orf40Q8WUR7 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
C15orf40Q8WUR7 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
C15orf40Q8WUR7 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
C15orf40Q8WUR7 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
C15orf40Q8WUR7 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
C15orf40Q8WUR7 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
C15orf40Q8WUR7 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
C15orf40Q8WUR7 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
C15orf40Q8WUR7 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
C15orf40Q8WUR7 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
C15orf40Q8WUR7 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
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C15orf40Q8WUR7 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
C15orf40Q8WUR7 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
C15orf40Q8WUR7 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
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C15orf40Q8WUR7 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
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C15orf40Q8WUR7 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
C15orf40Q8WUR7 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
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C15orf40Q8WUR7 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
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C15orf40Q8WUR7 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
C15orf40Q8WUR7 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
C15orf40Q8WUR7 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
C15orf40Q8WUR7 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
C15orf40Q8WUR7 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
C15orf40Q8WUR7 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
C15orf40Q8WUR7 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
C15orf40Q8WUR7 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
C15orf40Q8WUR7 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
C15orf40Q8WUR7 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
C15orf40Q8WUR7 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
C15orf40Q8WUR7 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
C15orf40Q8WUR7 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
C15orf40Q8WUR7 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
C15orf40Q8WUR7 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
C15orf40Q8WUR7 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
C15orf40Q8WUR7 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
C15orf40Q8WUR7 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
C15orf40Q8WUR7 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
C15orf40Q8WUR7 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
C15orf40Q8WUR7 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
C15orf40Q8WUR7 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
C15orf40Q8WUR7 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
C15orf40Q8WUR7 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
C15orf40Q8WUR7 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
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C15orf40Q8WUR7 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
C15orf40Q8WUR7 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
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