Protein–RNA interactions for Protein: Q8TF64

GIPC3, PDZ domain-containing protein GIPC3, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIPC3Q8TF64 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GIPC3Q8TF64 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GIPC3Q8TF64 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GIPC3Q8TF64 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GIPC3Q8TF64 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GIPC3Q8TF64 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GIPC3Q8TF64 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GIPC3Q8TF64 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GIPC3Q8TF64 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GIPC3Q8TF64 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GIPC3Q8TF64 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GIPC3Q8TF64 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
GIPC3Q8TF64 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GIPC3Q8TF64 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GIPC3Q8TF64 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GIPC3Q8TF64 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GIPC3Q8TF64 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GIPC3Q8TF64 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GIPC3Q8TF64 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GIPC3Q8TF64 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GIPC3Q8TF64 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GIPC3Q8TF64 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GIPC3Q8TF64 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GIPC3Q8TF64 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
GIPC3Q8TF64 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
GIPC3Q8TF64 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GIPC3Q8TF64 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GIPC3Q8TF64 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GIPC3Q8TF64 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GIPC3Q8TF64 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GIPC3Q8TF64 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GIPC3Q8TF64 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GIPC3Q8TF64 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GIPC3Q8TF64 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GIPC3Q8TF64 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GIPC3Q8TF64 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GIPC3Q8TF64 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GIPC3Q8TF64 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
GIPC3Q8TF64 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GIPC3Q8TF64 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GIPC3Q8TF64 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GIPC3Q8TF64 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GIPC3Q8TF64 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GIPC3Q8TF64 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GIPC3Q8TF64 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GIPC3Q8TF64 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GIPC3Q8TF64 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
GIPC3Q8TF64 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GIPC3Q8TF64 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GIPC3Q8TF64 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GIPC3Q8TF64 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GIPC3Q8TF64 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GIPC3Q8TF64 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GIPC3Q8TF64 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GIPC3Q8TF64 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GIPC3Q8TF64 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
GIPC3Q8TF64 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GIPC3Q8TF64 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GIPC3Q8TF64 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GIPC3Q8TF64 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GIPC3Q8TF64 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GIPC3Q8TF64 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GIPC3Q8TF64 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GIPC3Q8TF64 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GIPC3Q8TF64 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GIPC3Q8TF64 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GIPC3Q8TF64 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
GIPC3Q8TF64 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GIPC3Q8TF64 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GIPC3Q8TF64 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GIPC3Q8TF64 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GIPC3Q8TF64 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
GIPC3Q8TF64 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GIPC3Q8TF64 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GIPC3Q8TF64 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
GIPC3Q8TF64 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GIPC3Q8TF64 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GIPC3Q8TF64 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
GIPC3Q8TF64 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
GIPC3Q8TF64 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
GIPC3Q8TF64 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
GIPC3Q8TF64 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
GIPC3Q8TF64 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
GIPC3Q8TF64 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GIPC3Q8TF64 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GIPC3Q8TF64 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GIPC3Q8TF64 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GIPC3Q8TF64 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GIPC3Q8TF64 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GIPC3Q8TF64 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GIPC3Q8TF64 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GIPC3Q8TF64 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GIPC3Q8TF64 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GIPC3Q8TF64 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GIPC3Q8TF64 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GIPC3Q8TF64 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GIPC3Q8TF64 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GIPC3Q8TF64 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GIPC3Q8TF64 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GIPC3Q8TF64 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
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