Protein–RNA interactions for Protein: Q8ND23

CARMIL3, Capping protein, Arp2/3 and myosin-I linker protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARMIL3Q8ND23 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CARMIL3Q8ND23 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CARMIL3Q8ND23 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CARMIL3Q8ND23 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CARMIL3Q8ND23 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CARMIL3Q8ND23 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CARMIL3Q8ND23 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CARMIL3Q8ND23 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CARMIL3Q8ND23 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
CARMIL3Q8ND23 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CARMIL3Q8ND23 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CARMIL3Q8ND23 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CARMIL3Q8ND23 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CARMIL3Q8ND23 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CARMIL3Q8ND23 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CARMIL3Q8ND23 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CARMIL3Q8ND23 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CARMIL3Q8ND23 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CARMIL3Q8ND23 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
CARMIL3Q8ND23 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
CARMIL3Q8ND23 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CARMIL3Q8ND23 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CARMIL3Q8ND23 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CARMIL3Q8ND23 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CARMIL3Q8ND23 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CARMIL3Q8ND23 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CARMIL3Q8ND23 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CARMIL3Q8ND23 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CARMIL3Q8ND23 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CARMIL3Q8ND23 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CARMIL3Q8ND23 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CARMIL3Q8ND23 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CARMIL3Q8ND23 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CARMIL3Q8ND23 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CARMIL3Q8ND23 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CARMIL3Q8ND23 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CARMIL3Q8ND23 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CARMIL3Q8ND23 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CARMIL3Q8ND23 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CARMIL3Q8ND23 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CARMIL3Q8ND23 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CARMIL3Q8ND23 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CARMIL3Q8ND23 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CARMIL3Q8ND23 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CARMIL3Q8ND23 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CARMIL3Q8ND23 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CARMIL3Q8ND23 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CARMIL3Q8ND23 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CARMIL3Q8ND23 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CARMIL3Q8ND23 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CARMIL3Q8ND23 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CARMIL3Q8ND23 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CARMIL3Q8ND23 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CARMIL3Q8ND23 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CARMIL3Q8ND23 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CARMIL3Q8ND23 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CARMIL3Q8ND23 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CARMIL3Q8ND23 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CARMIL3Q8ND23 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CARMIL3Q8ND23 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CARMIL3Q8ND23 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CARMIL3Q8ND23 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
CARMIL3Q8ND23 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CARMIL3Q8ND23 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CARMIL3Q8ND23 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CARMIL3Q8ND23 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CARMIL3Q8ND23 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CARMIL3Q8ND23 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
CARMIL3Q8ND23 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CARMIL3Q8ND23 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
CARMIL3Q8ND23 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CARMIL3Q8ND23 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CARMIL3Q8ND23 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CARMIL3Q8ND23 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CARMIL3Q8ND23 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
CARMIL3Q8ND23 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CARMIL3Q8ND23 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CARMIL3Q8ND23 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CARMIL3Q8ND23 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
CARMIL3Q8ND23 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CARMIL3Q8ND23 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CARMIL3Q8ND23 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CARMIL3Q8ND23 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
CARMIL3Q8ND23 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CARMIL3Q8ND23 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
CARMIL3Q8ND23 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CARMIL3Q8ND23 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CARMIL3Q8ND23 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CARMIL3Q8ND23 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CARMIL3Q8ND23 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CARMIL3Q8ND23 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CARMIL3Q8ND23 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
CARMIL3Q8ND23 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CARMIL3Q8ND23 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CARMIL3Q8ND23 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CARMIL3Q8ND23 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CARMIL3Q8ND23 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CARMIL3Q8ND23 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CARMIL3Q8ND23 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CARMIL3Q8ND23 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.5 ms