Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCT1

ARRDC4, Arrestin domain-containing protein 4, humanhuman

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Length 418 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARRDC4Q8NCT1 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ARRDC4Q8NCT1 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ARRDC4Q8NCT1 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ARRDC4Q8NCT1 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ARRDC4Q8NCT1 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ARRDC4Q8NCT1 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ARRDC4Q8NCT1 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ARRDC4Q8NCT1 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ARRDC4Q8NCT1 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ARRDC4Q8NCT1 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ARRDC4Q8NCT1 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ARRDC4Q8NCT1 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ARRDC4Q8NCT1 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ARRDC4Q8NCT1 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ARRDC4Q8NCT1 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ARRDC4Q8NCT1 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ARRDC4Q8NCT1 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ARRDC4Q8NCT1 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ARRDC4Q8NCT1 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
ARRDC4Q8NCT1 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ARRDC4Q8NCT1 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ARRDC4Q8NCT1 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ARRDC4Q8NCT1 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ARRDC4Q8NCT1 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ARRDC4Q8NCT1 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ARRDC4Q8NCT1 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ARRDC4Q8NCT1 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ARRDC4Q8NCT1 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ARRDC4Q8NCT1 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ARRDC4Q8NCT1 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
ARRDC4Q8NCT1 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ARRDC4Q8NCT1 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ARRDC4Q8NCT1 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ARRDC4Q8NCT1 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
ARRDC4Q8NCT1 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ARRDC4Q8NCT1 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ARRDC4Q8NCT1 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ARRDC4Q8NCT1 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ARRDC4Q8NCT1 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ARRDC4Q8NCT1 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ARRDC4Q8NCT1 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ARRDC4Q8NCT1 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ARRDC4Q8NCT1 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
ARRDC4Q8NCT1 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ARRDC4Q8NCT1 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ARRDC4Q8NCT1 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ARRDC4Q8NCT1 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ARRDC4Q8NCT1 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ARRDC4Q8NCT1 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ARRDC4Q8NCT1 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ARRDC4Q8NCT1 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ARRDC4Q8NCT1 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ARRDC4Q8NCT1 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ARRDC4Q8NCT1 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ARRDC4Q8NCT1 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ARRDC4Q8NCT1 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ARRDC4Q8NCT1 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ARRDC4Q8NCT1 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ARRDC4Q8NCT1 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ARRDC4Q8NCT1 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ARRDC4Q8NCT1 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ARRDC4Q8NCT1 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ARRDC4Q8NCT1 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ARRDC4Q8NCT1 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ARRDC4Q8NCT1 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ARRDC4Q8NCT1 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ARRDC4Q8NCT1 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ARRDC4Q8NCT1 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ARRDC4Q8NCT1 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ARRDC4Q8NCT1 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
ARRDC4Q8NCT1 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ARRDC4Q8NCT1 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ARRDC4Q8NCT1 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ARRDC4Q8NCT1 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ARRDC4Q8NCT1 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ARRDC4Q8NCT1 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ARRDC4Q8NCT1 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ARRDC4Q8NCT1 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
ARRDC4Q8NCT1 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ARRDC4Q8NCT1 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ARRDC4Q8NCT1 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ARRDC4Q8NCT1 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ARRDC4Q8NCT1 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ARRDC4Q8NCT1 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ARRDC4Q8NCT1 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
ARRDC4Q8NCT1 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ARRDC4Q8NCT1 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ARRDC4Q8NCT1 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ARRDC4Q8NCT1 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ARRDC4Q8NCT1 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ARRDC4Q8NCT1 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ARRDC4Q8NCT1 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ARRDC4Q8NCT1 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ARRDC4Q8NCT1 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ARRDC4Q8NCT1 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ARRDC4Q8NCT1 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ARRDC4Q8NCT1 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ARRDC4Q8NCT1 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ARRDC4Q8NCT1 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ARRDC4Q8NCT1 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
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