Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCN4

RNF169, E3 ubiquitin-protein ligase RNF169, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF169Q8NCN4 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RNF169Q8NCN4 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RNF169Q8NCN4 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RNF169Q8NCN4 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RNF169Q8NCN4 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RNF169Q8NCN4 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RNF169Q8NCN4 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RNF169Q8NCN4 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RNF169Q8NCN4 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RNF169Q8NCN4 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RNF169Q8NCN4 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RNF169Q8NCN4 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RNF169Q8NCN4 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RNF169Q8NCN4 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RNF169Q8NCN4 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
RNF169Q8NCN4 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RNF169Q8NCN4 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RNF169Q8NCN4 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
RNF169Q8NCN4 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RNF169Q8NCN4 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RNF169Q8NCN4 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RNF169Q8NCN4 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RNF169Q8NCN4 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RNF169Q8NCN4 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RNF169Q8NCN4 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RNF169Q8NCN4 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RNF169Q8NCN4 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RNF169Q8NCN4 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RNF169Q8NCN4 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RNF169Q8NCN4 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RNF169Q8NCN4 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RNF169Q8NCN4 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RNF169Q8NCN4 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RNF169Q8NCN4 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RNF169Q8NCN4 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RNF169Q8NCN4 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RNF169Q8NCN4 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
RNF169Q8NCN4 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
RNF169Q8NCN4 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RNF169Q8NCN4 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RNF169Q8NCN4 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RNF169Q8NCN4 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RNF169Q8NCN4 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RNF169Q8NCN4 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RNF169Q8NCN4 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
RNF169Q8NCN4 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RNF169Q8NCN4 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RNF169Q8NCN4 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RNF169Q8NCN4 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RNF169Q8NCN4 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RNF169Q8NCN4 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RNF169Q8NCN4 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RNF169Q8NCN4 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RNF169Q8NCN4 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RNF169Q8NCN4 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RNF169Q8NCN4 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RNF169Q8NCN4 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RNF169Q8NCN4 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
RNF169Q8NCN4 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
RNF169Q8NCN4 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RNF169Q8NCN4 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
RNF169Q8NCN4 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RNF169Q8NCN4 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RNF169Q8NCN4 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RNF169Q8NCN4 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RNF169Q8NCN4 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RNF169Q8NCN4 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RNF169Q8NCN4 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RNF169Q8NCN4 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
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RNF169Q8NCN4 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RNF169Q8NCN4 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RNF169Q8NCN4 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RNF169Q8NCN4 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RNF169Q8NCN4 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RNF169Q8NCN4 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RNF169Q8NCN4 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RNF169Q8NCN4 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RNF169Q8NCN4 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
RNF169Q8NCN4 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
RNF169Q8NCN4 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RNF169Q8NCN4 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RNF169Q8NCN4 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RNF169Q8NCN4 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RNF169Q8NCN4 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RNF169Q8NCN4 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RNF169Q8NCN4 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RNF169Q8NCN4 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
RNF169Q8NCN4 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
RNF169Q8NCN4 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
RNF169Q8NCN4 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
RNF169Q8NCN4 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RNF169Q8NCN4 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RNF169Q8NCN4 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RNF169Q8NCN4 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RNF169Q8NCN4 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
RNF169Q8NCN4 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
RNF169Q8NCN4 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
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