Protein–RNA interactions for Protein: Q8N944

AMER3, APC membrane recruitment protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 861 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMER3Q8N944 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
AMER3Q8N944 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
AMER3Q8N944 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
AMER3Q8N944 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
AMER3Q8N944 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
AMER3Q8N944 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
AMER3Q8N944 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
AMER3Q8N944 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
AMER3Q8N944 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
AMER3Q8N944 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
AMER3Q8N944 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
AMER3Q8N944 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
AMER3Q8N944 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
AMER3Q8N944 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
AMER3Q8N944 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
AMER3Q8N944 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
AMER3Q8N944 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
AMER3Q8N944 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
AMER3Q8N944 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
AMER3Q8N944 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
AMER3Q8N944 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
AMER3Q8N944 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
AMER3Q8N944 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
AMER3Q8N944 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
AMER3Q8N944 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
AMER3Q8N944 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
AMER3Q8N944 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
AMER3Q8N944 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
AMER3Q8N944 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
AMER3Q8N944 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
AMER3Q8N944 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
AMER3Q8N944 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
AMER3Q8N944 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
AMER3Q8N944 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
AMER3Q8N944 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
AMER3Q8N944 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
AMER3Q8N944 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
AMER3Q8N944 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
AMER3Q8N944 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
AMER3Q8N944 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
AMER3Q8N944 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
AMER3Q8N944 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
AMER3Q8N944 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
AMER3Q8N944 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
AMER3Q8N944 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC18.92■□□□□ 0.62
AMER3Q8N944 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
AMER3Q8N944 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
AMER3Q8N944 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
AMER3Q8N944 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
AMER3Q8N944 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
AMER3Q8N944 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
AMER3Q8N944 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
AMER3Q8N944 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
AMER3Q8N944 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
AMER3Q8N944 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
AMER3Q8N944 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC18.92■□□□□ 0.62
AMER3Q8N944 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC18.92■□□□□ 0.62
AMER3Q8N944 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
AMER3Q8N944 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
AMER3Q8N944 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
AMER3Q8N944 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
AMER3Q8N944 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
AMER3Q8N944 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
AMER3Q8N944 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
AMER3Q8N944 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
AMER3Q8N944 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
AMER3Q8N944 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
AMER3Q8N944 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
AMER3Q8N944 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
AMER3Q8N944 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
AMER3Q8N944 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
AMER3Q8N944 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
AMER3Q8N944 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
AMER3Q8N944 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
AMER3Q8N944 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
AMER3Q8N944 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
AMER3Q8N944 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
AMER3Q8N944 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
AMER3Q8N944 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
AMER3Q8N944 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
AMER3Q8N944 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
AMER3Q8N944 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
AMER3Q8N944 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
AMER3Q8N944 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
AMER3Q8N944 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
AMER3Q8N944 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
AMER3Q8N944 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
AMER3Q8N944 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
AMER3Q8N944 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
AMER3Q8N944 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
AMER3Q8N944 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
AMER3Q8N944 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
AMER3Q8N944 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
AMER3Q8N944 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
AMER3Q8N944 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
AMER3Q8N944 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
AMER3Q8N944 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
AMER3Q8N944 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
AMER3Q8N944 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
AMER3Q8N944 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms