Protein–RNA interactions for Protein: Q8N8U3

RTL3, Retrotransposon Gag-like protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL3Q8N8U3 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RTL3Q8N8U3 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RTL3Q8N8U3 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RTL3Q8N8U3 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RTL3Q8N8U3 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RTL3Q8N8U3 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
RTL3Q8N8U3 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RTL3Q8N8U3 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
RTL3Q8N8U3 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RTL3Q8N8U3 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RTL3Q8N8U3 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RTL3Q8N8U3 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RTL3Q8N8U3 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RTL3Q8N8U3 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RTL3Q8N8U3 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RTL3Q8N8U3 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RTL3Q8N8U3 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RTL3Q8N8U3 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RTL3Q8N8U3 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RTL3Q8N8U3 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RTL3Q8N8U3 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
RTL3Q8N8U3 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RTL3Q8N8U3 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RTL3Q8N8U3 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RTL3Q8N8U3 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RTL3Q8N8U3 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RTL3Q8N8U3 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RTL3Q8N8U3 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
RTL3Q8N8U3 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RTL3Q8N8U3 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RTL3Q8N8U3 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RTL3Q8N8U3 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
RTL3Q8N8U3 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
RTL3Q8N8U3 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
RTL3Q8N8U3 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RTL3Q8N8U3 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RTL3Q8N8U3 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RTL3Q8N8U3 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RTL3Q8N8U3 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RTL3Q8N8U3 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RTL3Q8N8U3 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RTL3Q8N8U3 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RTL3Q8N8U3 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RTL3Q8N8U3 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RTL3Q8N8U3 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
RTL3Q8N8U3 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RTL3Q8N8U3 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RTL3Q8N8U3 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RTL3Q8N8U3 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RTL3Q8N8U3 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RTL3Q8N8U3 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RTL3Q8N8U3 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
RTL3Q8N8U3 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RTL3Q8N8U3 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
RTL3Q8N8U3 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RTL3Q8N8U3 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RTL3Q8N8U3 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RTL3Q8N8U3 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RTL3Q8N8U3 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RTL3Q8N8U3 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
RTL3Q8N8U3 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RTL3Q8N8U3 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RTL3Q8N8U3 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RTL3Q8N8U3 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RTL3Q8N8U3 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RTL3Q8N8U3 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RTL3Q8N8U3 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RTL3Q8N8U3 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RTL3Q8N8U3 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RTL3Q8N8U3 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RTL3Q8N8U3 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RTL3Q8N8U3 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
RTL3Q8N8U3 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
RTL3Q8N8U3 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RTL3Q8N8U3 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
RTL3Q8N8U3 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
RTL3Q8N8U3 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RTL3Q8N8U3 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RTL3Q8N8U3 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RTL3Q8N8U3 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RTL3Q8N8U3 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
RTL3Q8N8U3 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RTL3Q8N8U3 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RTL3Q8N8U3 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RTL3Q8N8U3 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RTL3Q8N8U3 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RTL3Q8N8U3 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RTL3Q8N8U3 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RTL3Q8N8U3 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RTL3Q8N8U3 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
RTL3Q8N8U3 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RTL3Q8N8U3 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
RTL3Q8N8U3 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RTL3Q8N8U3 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RTL3Q8N8U3 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RTL3Q8N8U3 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RTL3Q8N8U3 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
RTL3Q8N8U3 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RTL3Q8N8U3 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
RTL3Q8N8U3 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
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