Protein–RNA interactions for Protein: Q8N5Y2

MSL3, Male-specific lethal 3 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSL3Q8N5Y2 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MSL3Q8N5Y2 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MSL3Q8N5Y2 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MSL3Q8N5Y2 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MSL3Q8N5Y2 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MSL3Q8N5Y2 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MSL3Q8N5Y2 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MSL3Q8N5Y2 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MSL3Q8N5Y2 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MSL3Q8N5Y2 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MSL3Q8N5Y2 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MSL3Q8N5Y2 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MSL3Q8N5Y2 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MSL3Q8N5Y2 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MSL3Q8N5Y2 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MSL3Q8N5Y2 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MSL3Q8N5Y2 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MSL3Q8N5Y2 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MSL3Q8N5Y2 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MSL3Q8N5Y2 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
MSL3Q8N5Y2 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MSL3Q8N5Y2 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MSL3Q8N5Y2 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MSL3Q8N5Y2 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MSL3Q8N5Y2 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
MSL3Q8N5Y2 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MSL3Q8N5Y2 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MSL3Q8N5Y2 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MSL3Q8N5Y2 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MSL3Q8N5Y2 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MSL3Q8N5Y2 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MSL3Q8N5Y2 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MSL3Q8N5Y2 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MSL3Q8N5Y2 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MSL3Q8N5Y2 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MSL3Q8N5Y2 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
MSL3Q8N5Y2 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MSL3Q8N5Y2 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MSL3Q8N5Y2 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MSL3Q8N5Y2 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MSL3Q8N5Y2 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MSL3Q8N5Y2 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MSL3Q8N5Y2 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
MSL3Q8N5Y2 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MSL3Q8N5Y2 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MSL3Q8N5Y2 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MSL3Q8N5Y2 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MSL3Q8N5Y2 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MSL3Q8N5Y2 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MSL3Q8N5Y2 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MSL3Q8N5Y2 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MSL3Q8N5Y2 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MSL3Q8N5Y2 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
MSL3Q8N5Y2 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MSL3Q8N5Y2 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
MSL3Q8N5Y2 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MSL3Q8N5Y2 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
MSL3Q8N5Y2 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MSL3Q8N5Y2 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MSL3Q8N5Y2 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MSL3Q8N5Y2 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MSL3Q8N5Y2 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MSL3Q8N5Y2 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MSL3Q8N5Y2 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MSL3Q8N5Y2 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
MSL3Q8N5Y2 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MSL3Q8N5Y2 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
MSL3Q8N5Y2 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MSL3Q8N5Y2 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MSL3Q8N5Y2 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MSL3Q8N5Y2 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MSL3Q8N5Y2 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MSL3Q8N5Y2 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MSL3Q8N5Y2 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
MSL3Q8N5Y2 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MSL3Q8N5Y2 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MSL3Q8N5Y2 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MSL3Q8N5Y2 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MSL3Q8N5Y2 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MSL3Q8N5Y2 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MSL3Q8N5Y2 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MSL3Q8N5Y2 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MSL3Q8N5Y2 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MSL3Q8N5Y2 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MSL3Q8N5Y2 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MSL3Q8N5Y2 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MSL3Q8N5Y2 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MSL3Q8N5Y2 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
MSL3Q8N5Y2 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MSL3Q8N5Y2 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MSL3Q8N5Y2 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MSL3Q8N5Y2 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MSL3Q8N5Y2 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MSL3Q8N5Y2 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MSL3Q8N5Y2 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
MSL3Q8N5Y2 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MSL3Q8N5Y2 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
MSL3Q8N5Y2 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
MSL3Q8N5Y2 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MSL3Q8N5Y2 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms