Protein–RNA interactions for Protein: Q8N137

CNTROB, Centrobin, humanhuman

Predictions only

Length 903 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTROBQ8N137 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CNTROBQ8N137 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CNTROBQ8N137 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CNTROBQ8N137 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CNTROBQ8N137 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CNTROBQ8N137 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CNTROBQ8N137 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CNTROBQ8N137 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CNTROBQ8N137 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CNTROBQ8N137 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CNTROBQ8N137 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CNTROBQ8N137 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CNTROBQ8N137 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CNTROBQ8N137 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CNTROBQ8N137 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
CNTROBQ8N137 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CNTROBQ8N137 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CNTROBQ8N137 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CNTROBQ8N137 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CNTROBQ8N137 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CNTROBQ8N137 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CNTROBQ8N137 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CNTROBQ8N137 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CNTROBQ8N137 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CNTROBQ8N137 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CNTROBQ8N137 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CNTROBQ8N137 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CNTROBQ8N137 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CNTROBQ8N137 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CNTROBQ8N137 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CNTROBQ8N137 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CNTROBQ8N137 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CNTROBQ8N137 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CNTROBQ8N137 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CNTROBQ8N137 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
CNTROBQ8N137 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CNTROBQ8N137 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CNTROBQ8N137 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CNTROBQ8N137 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CNTROBQ8N137 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CNTROBQ8N137 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CNTROBQ8N137 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CNTROBQ8N137 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CNTROBQ8N137 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CNTROBQ8N137 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CNTROBQ8N137 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CNTROBQ8N137 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CNTROBQ8N137 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CNTROBQ8N137 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CNTROBQ8N137 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CNTROBQ8N137 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CNTROBQ8N137 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CNTROBQ8N137 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CNTROBQ8N137 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CNTROBQ8N137 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CNTROBQ8N137 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
CNTROBQ8N137 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CNTROBQ8N137 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CNTROBQ8N137 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CNTROBQ8N137 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CNTROBQ8N137 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CNTROBQ8N137 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CNTROBQ8N137 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CNTROBQ8N137 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CNTROBQ8N137 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CNTROBQ8N137 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CNTROBQ8N137 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CNTROBQ8N137 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CNTROBQ8N137 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CNTROBQ8N137 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CNTROBQ8N137 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CNTROBQ8N137 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CNTROBQ8N137 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CNTROBQ8N137 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CNTROBQ8N137 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CNTROBQ8N137 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CNTROBQ8N137 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CNTROBQ8N137 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CNTROBQ8N137 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CNTROBQ8N137 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CNTROBQ8N137 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CNTROBQ8N137 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CNTROBQ8N137 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CNTROBQ8N137 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CNTROBQ8N137 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CNTROBQ8N137 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CNTROBQ8N137 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CNTROBQ8N137 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CNTROBQ8N137 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CNTROBQ8N137 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CNTROBQ8N137 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
CNTROBQ8N137 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CNTROBQ8N137 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CNTROBQ8N137 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CNTROBQ8N137 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CNTROBQ8N137 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CNTROBQ8N137 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CNTROBQ8N137 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CNTROBQ8N137 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CNTROBQ8N137 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.5 ms