Protein–RNA interactions for Protein: Q8IX21

SLF2, SMC5-SMC6 complex localization factor protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLF2Q8IX21 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLF2Q8IX21 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLF2Q8IX21 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLF2Q8IX21 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLF2Q8IX21 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLF2Q8IX21 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLF2Q8IX21 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLF2Q8IX21 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SLF2Q8IX21 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLF2Q8IX21 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLF2Q8IX21 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLF2Q8IX21 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLF2Q8IX21 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLF2Q8IX21 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLF2Q8IX21 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLF2Q8IX21 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLF2Q8IX21 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLF2Q8IX21 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
SLF2Q8IX21 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
SLF2Q8IX21 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
SLF2Q8IX21 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLF2Q8IX21 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLF2Q8IX21 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLF2Q8IX21 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLF2Q8IX21 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLF2Q8IX21 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLF2Q8IX21 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLF2Q8IX21 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLF2Q8IX21 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLF2Q8IX21 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLF2Q8IX21 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLF2Q8IX21 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLF2Q8IX21 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLF2Q8IX21 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLF2Q8IX21 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLF2Q8IX21 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLF2Q8IX21 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLF2Q8IX21 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLF2Q8IX21 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLF2Q8IX21 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLF2Q8IX21 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLF2Q8IX21 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLF2Q8IX21 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLF2Q8IX21 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
SLF2Q8IX21 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLF2Q8IX21 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLF2Q8IX21 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLF2Q8IX21 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLF2Q8IX21 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
SLF2Q8IX21 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLF2Q8IX21 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLF2Q8IX21 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLF2Q8IX21 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLF2Q8IX21 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLF2Q8IX21 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLF2Q8IX21 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLF2Q8IX21 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLF2Q8IX21 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLF2Q8IX21 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLF2Q8IX21 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLF2Q8IX21 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLF2Q8IX21 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLF2Q8IX21 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
SLF2Q8IX21 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLF2Q8IX21 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
SLF2Q8IX21 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLF2Q8IX21 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLF2Q8IX21 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLF2Q8IX21 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLF2Q8IX21 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLF2Q8IX21 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLF2Q8IX21 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLF2Q8IX21 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLF2Q8IX21 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLF2Q8IX21 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLF2Q8IX21 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLF2Q8IX21 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLF2Q8IX21 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLF2Q8IX21 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLF2Q8IX21 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLF2Q8IX21 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLF2Q8IX21 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLF2Q8IX21 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLF2Q8IX21 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLF2Q8IX21 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLF2Q8IX21 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLF2Q8IX21 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLF2Q8IX21 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLF2Q8IX21 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLF2Q8IX21 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLF2Q8IX21 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLF2Q8IX21 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
SLF2Q8IX21 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLF2Q8IX21 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLF2Q8IX21 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
SLF2Q8IX21 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLF2Q8IX21 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLF2Q8IX21 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
SLF2Q8IX21 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
SLF2Q8IX21 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68 ms