Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWD4

CCDC117, Coiled-coil domain-containing protein 117, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC117Q8IWD4 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC117Q8IWD4 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC117Q8IWD4 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC117Q8IWD4 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC117Q8IWD4 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC117Q8IWD4 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC117Q8IWD4 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC117Q8IWD4 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC117Q8IWD4 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC117Q8IWD4 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC117Q8IWD4 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC117Q8IWD4 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC117Q8IWD4 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC117Q8IWD4 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC117Q8IWD4 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC117Q8IWD4 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC117Q8IWD4 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC117Q8IWD4 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC117Q8IWD4 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC117Q8IWD4 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC117Q8IWD4 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CCDC117Q8IWD4 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC117Q8IWD4 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC117Q8IWD4 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC117Q8IWD4 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC117Q8IWD4 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC117Q8IWD4 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC117Q8IWD4 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC117Q8IWD4 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC117Q8IWD4 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC117Q8IWD4 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC117Q8IWD4 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC117Q8IWD4 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC117Q8IWD4 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC117Q8IWD4 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC117Q8IWD4 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC117Q8IWD4 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC117Q8IWD4 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC117Q8IWD4 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC117Q8IWD4 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC117Q8IWD4 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC117Q8IWD4 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC117Q8IWD4 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC117Q8IWD4 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC117Q8IWD4 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC117Q8IWD4 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CCDC117Q8IWD4 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC117Q8IWD4 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC117Q8IWD4 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC117Q8IWD4 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC117Q8IWD4 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC117Q8IWD4 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC117Q8IWD4 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC117Q8IWD4 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC117Q8IWD4 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC117Q8IWD4 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC117Q8IWD4 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC117Q8IWD4 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC117Q8IWD4 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC117Q8IWD4 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC117Q8IWD4 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC117Q8IWD4 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC117Q8IWD4 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC117Q8IWD4 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC117Q8IWD4 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC117Q8IWD4 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC117Q8IWD4 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC117Q8IWD4 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC117Q8IWD4 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC117Q8IWD4 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC117Q8IWD4 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC117Q8IWD4 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC117Q8IWD4 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC117Q8IWD4 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CCDC117Q8IWD4 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC117Q8IWD4 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC117Q8IWD4 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC117Q8IWD4 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC117Q8IWD4 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC117Q8IWD4 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC117Q8IWD4 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC117Q8IWD4 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC117Q8IWD4 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC117Q8IWD4 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC117Q8IWD4 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC117Q8IWD4 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC117Q8IWD4 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC117Q8IWD4 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC117Q8IWD4 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC117Q8IWD4 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC117Q8IWD4 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC117Q8IWD4 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CCDC117Q8IWD4 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CCDC117Q8IWD4 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CCDC117Q8IWD4 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CCDC117Q8IWD4 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
CCDC117Q8IWD4 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CCDC117Q8IWD4 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
CCDC117Q8IWD4 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
CCDC117Q8IWD4 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.1 ms