Protein–RNA interactions for Protein: Q86UW8

HAPLN4, Hyaluronan and proteoglycan link protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HAPLN4Q86UW8 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HAPLN4Q86UW8 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HAPLN4Q86UW8 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HAPLN4Q86UW8 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HAPLN4Q86UW8 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HAPLN4Q86UW8 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HAPLN4Q86UW8 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HAPLN4Q86UW8 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HAPLN4Q86UW8 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HAPLN4Q86UW8 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HAPLN4Q86UW8 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HAPLN4Q86UW8 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
HAPLN4Q86UW8 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
HAPLN4Q86UW8 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
HAPLN4Q86UW8 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HAPLN4Q86UW8 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
HAPLN4Q86UW8 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HAPLN4Q86UW8 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HAPLN4Q86UW8 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HAPLN4Q86UW8 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HAPLN4Q86UW8 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HAPLN4Q86UW8 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HAPLN4Q86UW8 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HAPLN4Q86UW8 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HAPLN4Q86UW8 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HAPLN4Q86UW8 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HAPLN4Q86UW8 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HAPLN4Q86UW8 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HAPLN4Q86UW8 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HAPLN4Q86UW8 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HAPLN4Q86UW8 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HAPLN4Q86UW8 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HAPLN4Q86UW8 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HAPLN4Q86UW8 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HAPLN4Q86UW8 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HAPLN4Q86UW8 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HAPLN4Q86UW8 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HAPLN4Q86UW8 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HAPLN4Q86UW8 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
HAPLN4Q86UW8 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HAPLN4Q86UW8 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HAPLN4Q86UW8 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
HAPLN4Q86UW8 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HAPLN4Q86UW8 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HAPLN4Q86UW8 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HAPLN4Q86UW8 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HAPLN4Q86UW8 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HAPLN4Q86UW8 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HAPLN4Q86UW8 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HAPLN4Q86UW8 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HAPLN4Q86UW8 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HAPLN4Q86UW8 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HAPLN4Q86UW8 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HAPLN4Q86UW8 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HAPLN4Q86UW8 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HAPLN4Q86UW8 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HAPLN4Q86UW8 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HAPLN4Q86UW8 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HAPLN4Q86UW8 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HAPLN4Q86UW8 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HAPLN4Q86UW8 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HAPLN4Q86UW8 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HAPLN4Q86UW8 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HAPLN4Q86UW8 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HAPLN4Q86UW8 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HAPLN4Q86UW8 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HAPLN4Q86UW8 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
HAPLN4Q86UW8 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HAPLN4Q86UW8 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HAPLN4Q86UW8 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HAPLN4Q86UW8 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HAPLN4Q86UW8 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HAPLN4Q86UW8 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HAPLN4Q86UW8 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HAPLN4Q86UW8 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HAPLN4Q86UW8 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HAPLN4Q86UW8 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HAPLN4Q86UW8 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HAPLN4Q86UW8 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HAPLN4Q86UW8 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HAPLN4Q86UW8 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HAPLN4Q86UW8 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HAPLN4Q86UW8 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HAPLN4Q86UW8 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HAPLN4Q86UW8 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HAPLN4Q86UW8 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HAPLN4Q86UW8 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HAPLN4Q86UW8 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HAPLN4Q86UW8 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HAPLN4Q86UW8 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HAPLN4Q86UW8 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HAPLN4Q86UW8 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HAPLN4Q86UW8 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HAPLN4Q86UW8 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HAPLN4Q86UW8 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HAPLN4Q86UW8 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HAPLN4Q86UW8 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HAPLN4Q86UW8 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HAPLN4Q86UW8 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HAPLN4Q86UW8 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms