Protein–RNA interactions for Protein: Q86SS6

SYT9, Synaptotagmin-9, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT9Q86SS6 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SYT9Q86SS6 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SYT9Q86SS6 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SYT9Q86SS6 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SYT9Q86SS6 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SYT9Q86SS6 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SYT9Q86SS6 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SYT9Q86SS6 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SYT9Q86SS6 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SYT9Q86SS6 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SYT9Q86SS6 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SYT9Q86SS6 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SYT9Q86SS6 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SYT9Q86SS6 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SYT9Q86SS6 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SYT9Q86SS6 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SYT9Q86SS6 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SYT9Q86SS6 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SYT9Q86SS6 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SYT9Q86SS6 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SYT9Q86SS6 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
SYT9Q86SS6 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SYT9Q86SS6 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SYT9Q86SS6 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SYT9Q86SS6 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SYT9Q86SS6 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
SYT9Q86SS6 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
SYT9Q86SS6 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SYT9Q86SS6 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SYT9Q86SS6 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SYT9Q86SS6 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SYT9Q86SS6 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SYT9Q86SS6 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SYT9Q86SS6 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SYT9Q86SS6 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SYT9Q86SS6 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SYT9Q86SS6 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
SYT9Q86SS6 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SYT9Q86SS6 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SYT9Q86SS6 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SYT9Q86SS6 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SYT9Q86SS6 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SYT9Q86SS6 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SYT9Q86SS6 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SYT9Q86SS6 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
SYT9Q86SS6 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
SYT9Q86SS6 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SYT9Q86SS6 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
SYT9Q86SS6 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SYT9Q86SS6 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SYT9Q86SS6 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SYT9Q86SS6 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SYT9Q86SS6 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SYT9Q86SS6 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SYT9Q86SS6 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SYT9Q86SS6 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SYT9Q86SS6 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SYT9Q86SS6 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SYT9Q86SS6 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SYT9Q86SS6 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
SYT9Q86SS6 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
SYT9Q86SS6 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SYT9Q86SS6 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SYT9Q86SS6 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SYT9Q86SS6 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SYT9Q86SS6 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
SYT9Q86SS6 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SYT9Q86SS6 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
SYT9Q86SS6 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SYT9Q86SS6 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SYT9Q86SS6 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SYT9Q86SS6 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SYT9Q86SS6 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SYT9Q86SS6 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SYT9Q86SS6 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SYT9Q86SS6 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SYT9Q86SS6 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SYT9Q86SS6 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SYT9Q86SS6 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SYT9Q86SS6 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SYT9Q86SS6 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SYT9Q86SS6 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SYT9Q86SS6 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SYT9Q86SS6 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SYT9Q86SS6 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SYT9Q86SS6 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SYT9Q86SS6 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SYT9Q86SS6 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SYT9Q86SS6 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SYT9Q86SS6 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SYT9Q86SS6 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SYT9Q86SS6 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SYT9Q86SS6 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SYT9Q86SS6 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
SYT9Q86SS6 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
SYT9Q86SS6 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SYT9Q86SS6 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SYT9Q86SS6 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
SYT9Q86SS6 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
SYT9Q86SS6 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms