Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3V4

UBE3B, Ubiquitin-protein ligase E3B, humanhuman

Predictions only

Length 1,068 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3BQ7Z3V4 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
UBE3BQ7Z3V4 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
UBE3BQ7Z3V4 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
UBE3BQ7Z3V4 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
UBE3BQ7Z3V4 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
UBE3BQ7Z3V4 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
UBE3BQ7Z3V4 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
UBE3BQ7Z3V4 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
UBE3BQ7Z3V4 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
UBE3BQ7Z3V4 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
UBE3BQ7Z3V4 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
UBE3BQ7Z3V4 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
UBE3BQ7Z3V4 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
UBE3BQ7Z3V4 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
UBE3BQ7Z3V4 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
UBE3BQ7Z3V4 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
UBE3BQ7Z3V4 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
UBE3BQ7Z3V4 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC24.8■■□□□ 1.56
UBE3BQ7Z3V4 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
UBE3BQ7Z3V4 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
UBE3BQ7Z3V4 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
UBE3BQ7Z3V4 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
UBE3BQ7Z3V4 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
UBE3BQ7Z3V4 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
UBE3BQ7Z3V4 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
UBE3BQ7Z3V4 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
UBE3BQ7Z3V4 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
UBE3BQ7Z3V4 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
UBE3BQ7Z3V4 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
UBE3BQ7Z3V4 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
UBE3BQ7Z3V4 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
UBE3BQ7Z3V4 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
UBE3BQ7Z3V4 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
UBE3BQ7Z3V4 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
UBE3BQ7Z3V4 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
UBE3BQ7Z3V4 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
UBE3BQ7Z3V4 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
UBE3BQ7Z3V4 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
UBE3BQ7Z3V4 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
UBE3BQ7Z3V4 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
UBE3BQ7Z3V4 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
UBE3BQ7Z3V4 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
UBE3BQ7Z3V4 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
UBE3BQ7Z3V4 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
UBE3BQ7Z3V4 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
UBE3BQ7Z3V4 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
UBE3BQ7Z3V4 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
UBE3BQ7Z3V4 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
UBE3BQ7Z3V4 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
UBE3BQ7Z3V4 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
UBE3BQ7Z3V4 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
UBE3BQ7Z3V4 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
UBE3BQ7Z3V4 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
UBE3BQ7Z3V4 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
UBE3BQ7Z3V4 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
UBE3BQ7Z3V4 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
UBE3BQ7Z3V4 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
UBE3BQ7Z3V4 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
UBE3BQ7Z3V4 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
UBE3BQ7Z3V4 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
UBE3BQ7Z3V4 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
UBE3BQ7Z3V4 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
UBE3BQ7Z3V4 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
UBE3BQ7Z3V4 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
UBE3BQ7Z3V4 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
UBE3BQ7Z3V4 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
UBE3BQ7Z3V4 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
UBE3BQ7Z3V4 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
UBE3BQ7Z3V4 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
UBE3BQ7Z3V4 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
UBE3BQ7Z3V4 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
UBE3BQ7Z3V4 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
UBE3BQ7Z3V4 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
UBE3BQ7Z3V4 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
UBE3BQ7Z3V4 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
UBE3BQ7Z3V4 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
UBE3BQ7Z3V4 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
UBE3BQ7Z3V4 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
UBE3BQ7Z3V4 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
UBE3BQ7Z3V4 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
UBE3BQ7Z3V4 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
UBE3BQ7Z3V4 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
UBE3BQ7Z3V4 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
UBE3BQ7Z3V4 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
UBE3BQ7Z3V4 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
UBE3BQ7Z3V4 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
UBE3BQ7Z3V4 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
UBE3BQ7Z3V4 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
UBE3BQ7Z3V4 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
UBE3BQ7Z3V4 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
UBE3BQ7Z3V4 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
UBE3BQ7Z3V4 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
UBE3BQ7Z3V4 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
UBE3BQ7Z3V4 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
UBE3BQ7Z3V4 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
UBE3BQ7Z3V4 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
UBE3BQ7Z3V4 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
UBE3BQ7Z3V4 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
UBE3BQ7Z3V4 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
UBE3BQ7Z3V4 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.6 ms