Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z2E3

APTX, Aprataxin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APTXQ7Z2E3 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
APTXQ7Z2E3 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
APTXQ7Z2E3 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
APTXQ7Z2E3 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
APTXQ7Z2E3 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC21.66■■□□□ 1.06
APTXQ7Z2E3 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
APTXQ7Z2E3 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
APTXQ7Z2E3 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
APTXQ7Z2E3 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
APTXQ7Z2E3 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
APTXQ7Z2E3 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
APTXQ7Z2E3 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
APTXQ7Z2E3 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
APTXQ7Z2E3 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
APTXQ7Z2E3 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
APTXQ7Z2E3 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
APTXQ7Z2E3 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
APTXQ7Z2E3 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC21.65■■□□□ 1.06
APTXQ7Z2E3 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
APTXQ7Z2E3 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
APTXQ7Z2E3 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
APTXQ7Z2E3 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
APTXQ7Z2E3 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
APTXQ7Z2E3 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
APTXQ7Z2E3 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
APTXQ7Z2E3 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
APTXQ7Z2E3 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
APTXQ7Z2E3 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
APTXQ7Z2E3 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
APTXQ7Z2E3 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
APTXQ7Z2E3 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
APTXQ7Z2E3 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
APTXQ7Z2E3 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
APTXQ7Z2E3 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
APTXQ7Z2E3 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
APTXQ7Z2E3 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
APTXQ7Z2E3 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
APTXQ7Z2E3 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
APTXQ7Z2E3 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
APTXQ7Z2E3 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
APTXQ7Z2E3 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
APTXQ7Z2E3 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
APTXQ7Z2E3 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
APTXQ7Z2E3 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
APTXQ7Z2E3 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
APTXQ7Z2E3 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
APTXQ7Z2E3 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
APTXQ7Z2E3 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
APTXQ7Z2E3 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
APTXQ7Z2E3 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
APTXQ7Z2E3 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
APTXQ7Z2E3 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
APTXQ7Z2E3 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
APTXQ7Z2E3 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
APTXQ7Z2E3 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
APTXQ7Z2E3 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
APTXQ7Z2E3 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
APTXQ7Z2E3 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
APTXQ7Z2E3 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
APTXQ7Z2E3 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
APTXQ7Z2E3 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
APTXQ7Z2E3 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
APTXQ7Z2E3 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
APTXQ7Z2E3 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
APTXQ7Z2E3 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
APTXQ7Z2E3 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
APTXQ7Z2E3 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
APTXQ7Z2E3 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
APTXQ7Z2E3 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
APTXQ7Z2E3 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
APTXQ7Z2E3 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
APTXQ7Z2E3 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
APTXQ7Z2E3 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
APTXQ7Z2E3 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
APTXQ7Z2E3 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
APTXQ7Z2E3 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
APTXQ7Z2E3 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
APTXQ7Z2E3 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
APTXQ7Z2E3 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
APTXQ7Z2E3 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
APTXQ7Z2E3 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
APTXQ7Z2E3 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
APTXQ7Z2E3 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
APTXQ7Z2E3 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
APTXQ7Z2E3 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
APTXQ7Z2E3 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
APTXQ7Z2E3 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
APTXQ7Z2E3 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
APTXQ7Z2E3 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
APTXQ7Z2E3 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
APTXQ7Z2E3 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
APTXQ7Z2E3 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
APTXQ7Z2E3 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
APTXQ7Z2E3 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
APTXQ7Z2E3 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
APTXQ7Z2E3 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
APTXQ7Z2E3 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
APTXQ7Z2E3 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
APTXQ7Z2E3 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
APTXQ7Z2E3 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms