Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTX7

CATSPER4, Cation channel sperm-associated protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CATSPER4Q7RTX7 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CATSPER4Q7RTX7 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CATSPER4Q7RTX7 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
CATSPER4Q7RTX7 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CATSPER4Q7RTX7 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CATSPER4Q7RTX7 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CATSPER4Q7RTX7 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CATSPER4Q7RTX7 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CATSPER4Q7RTX7 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CATSPER4Q7RTX7 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CATSPER4Q7RTX7 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CATSPER4Q7RTX7 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CATSPER4Q7RTX7 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CATSPER4Q7RTX7 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CATSPER4Q7RTX7 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CATSPER4Q7RTX7 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CATSPER4Q7RTX7 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CATSPER4Q7RTX7 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
CATSPER4Q7RTX7 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CATSPER4Q7RTX7 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CATSPER4Q7RTX7 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CATSPER4Q7RTX7 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CATSPER4Q7RTX7 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CATSPER4Q7RTX7 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CATSPER4Q7RTX7 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CATSPER4Q7RTX7 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CATSPER4Q7RTX7 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CATSPER4Q7RTX7 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CATSPER4Q7RTX7 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CATSPER4Q7RTX7 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CATSPER4Q7RTX7 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CATSPER4Q7RTX7 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
CATSPER4Q7RTX7 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CATSPER4Q7RTX7 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CATSPER4Q7RTX7 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
CATSPER4Q7RTX7 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CATSPER4Q7RTX7 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CATSPER4Q7RTX7 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
CATSPER4Q7RTX7 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CATSPER4Q7RTX7 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CATSPER4Q7RTX7 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CATSPER4Q7RTX7 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CATSPER4Q7RTX7 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CATSPER4Q7RTX7 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CATSPER4Q7RTX7 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CATSPER4Q7RTX7 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CATSPER4Q7RTX7 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CATSPER4Q7RTX7 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CATSPER4Q7RTX7 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CATSPER4Q7RTX7 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CATSPER4Q7RTX7 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
CATSPER4Q7RTX7 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CATSPER4Q7RTX7 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CATSPER4Q7RTX7 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CATSPER4Q7RTX7 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CATSPER4Q7RTX7 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
CATSPER4Q7RTX7 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
CATSPER4Q7RTX7 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CATSPER4Q7RTX7 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CATSPER4Q7RTX7 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CATSPER4Q7RTX7 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CATSPER4Q7RTX7 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CATSPER4Q7RTX7 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CATSPER4Q7RTX7 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CATSPER4Q7RTX7 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CATSPER4Q7RTX7 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CATSPER4Q7RTX7 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CATSPER4Q7RTX7 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CATSPER4Q7RTX7 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CATSPER4Q7RTX7 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CATSPER4Q7RTX7 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CATSPER4Q7RTX7 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
CATSPER4Q7RTX7 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CATSPER4Q7RTX7 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CATSPER4Q7RTX7 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CATSPER4Q7RTX7 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CATSPER4Q7RTX7 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
CATSPER4Q7RTX7 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CATSPER4Q7RTX7 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CATSPER4Q7RTX7 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
CATSPER4Q7RTX7 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CATSPER4Q7RTX7 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CATSPER4Q7RTX7 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
CATSPER4Q7RTX7 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CATSPER4Q7RTX7 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
CATSPER4Q7RTX7 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CATSPER4Q7RTX7 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CATSPER4Q7RTX7 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CATSPER4Q7RTX7 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
CATSPER4Q7RTX7 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CATSPER4Q7RTX7 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CATSPER4Q7RTX7 TMEM263-208ENST00000551489 621 ntTSL 4 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CATSPER4Q7RTX7 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CATSPER4Q7RTX7 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CATSPER4Q7RTX7 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
CATSPER4Q7RTX7 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CATSPER4Q7RTX7 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CATSPER4Q7RTX7 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CATSPER4Q7RTX7 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CATSPER4Q7RTX7 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms