Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTM1

OTOP1, Otopetrin-1, humanhuman

Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTOP1Q7RTM1 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
OTOP1Q7RTM1 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
OTOP1Q7RTM1 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
OTOP1Q7RTM1 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
OTOP1Q7RTM1 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
OTOP1Q7RTM1 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
OTOP1Q7RTM1 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
OTOP1Q7RTM1 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
OTOP1Q7RTM1 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
OTOP1Q7RTM1 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
OTOP1Q7RTM1 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
OTOP1Q7RTM1 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
OTOP1Q7RTM1 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
OTOP1Q7RTM1 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
OTOP1Q7RTM1 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
OTOP1Q7RTM1 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
OTOP1Q7RTM1 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
OTOP1Q7RTM1 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
OTOP1Q7RTM1 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
OTOP1Q7RTM1 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
OTOP1Q7RTM1 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
OTOP1Q7RTM1 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
OTOP1Q7RTM1 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
OTOP1Q7RTM1 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
OTOP1Q7RTM1 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
OTOP1Q7RTM1 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
OTOP1Q7RTM1 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
OTOP1Q7RTM1 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
OTOP1Q7RTM1 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
OTOP1Q7RTM1 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
OTOP1Q7RTM1 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
OTOP1Q7RTM1 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
OTOP1Q7RTM1 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
OTOP1Q7RTM1 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
OTOP1Q7RTM1 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
OTOP1Q7RTM1 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
OTOP1Q7RTM1 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
OTOP1Q7RTM1 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
OTOP1Q7RTM1 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
OTOP1Q7RTM1 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
OTOP1Q7RTM1 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
OTOP1Q7RTM1 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
OTOP1Q7RTM1 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
OTOP1Q7RTM1 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
OTOP1Q7RTM1 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
OTOP1Q7RTM1 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
OTOP1Q7RTM1 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC23.04■■□□□ 1.28
OTOP1Q7RTM1 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
OTOP1Q7RTM1 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
OTOP1Q7RTM1 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
OTOP1Q7RTM1 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
OTOP1Q7RTM1 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
OTOP1Q7RTM1 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
OTOP1Q7RTM1 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
OTOP1Q7RTM1 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
OTOP1Q7RTM1 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
OTOP1Q7RTM1 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
OTOP1Q7RTM1 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
OTOP1Q7RTM1 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
OTOP1Q7RTM1 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
OTOP1Q7RTM1 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
OTOP1Q7RTM1 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
OTOP1Q7RTM1 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
OTOP1Q7RTM1 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
OTOP1Q7RTM1 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
OTOP1Q7RTM1 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
OTOP1Q7RTM1 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
OTOP1Q7RTM1 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
OTOP1Q7RTM1 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
OTOP1Q7RTM1 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
OTOP1Q7RTM1 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
OTOP1Q7RTM1 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
OTOP1Q7RTM1 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
OTOP1Q7RTM1 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
OTOP1Q7RTM1 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
OTOP1Q7RTM1 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
OTOP1Q7RTM1 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
OTOP1Q7RTM1 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
OTOP1Q7RTM1 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
OTOP1Q7RTM1 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
OTOP1Q7RTM1 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
OTOP1Q7RTM1 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
OTOP1Q7RTM1 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
OTOP1Q7RTM1 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
OTOP1Q7RTM1 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
OTOP1Q7RTM1 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
OTOP1Q7RTM1 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
OTOP1Q7RTM1 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
OTOP1Q7RTM1 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
OTOP1Q7RTM1 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
OTOP1Q7RTM1 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
OTOP1Q7RTM1 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
OTOP1Q7RTM1 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
OTOP1Q7RTM1 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
OTOP1Q7RTM1 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
OTOP1Q7RTM1 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
OTOP1Q7RTM1 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
OTOP1Q7RTM1 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
OTOP1Q7RTM1 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
OTOP1Q7RTM1 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms