Protein–RNA interactions for Protein: Q76N89

HECW1, E3 ubiquitin-protein ligase HECW1, humanhuman

Predictions only

Length 1,606 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HECW1Q76N89 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
HECW1Q76N89 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
HECW1Q76N89 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
HECW1Q76N89 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
HECW1Q76N89 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC30.96■■■□□ 2.55
HECW1Q76N89 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC30.96■■■□□ 2.55
HECW1Q76N89 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
HECW1Q76N89 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.95■■■□□ 2.55
HECW1Q76N89 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
HECW1Q76N89 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.55
HECW1Q76N89 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
HECW1Q76N89 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
HECW1Q76N89 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
HECW1Q76N89 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC30.95■■■□□ 2.54
HECW1Q76N89 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
HECW1Q76N89 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC30.95■■■□□ 2.54
HECW1Q76N89 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.54
HECW1Q76N89 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
HECW1Q76N89 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC30.94■■■□□ 2.54
HECW1Q76N89 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
HECW1Q76N89 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC30.94■■■□□ 2.54
HECW1Q76N89 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC30.94■■■□□ 2.54
HECW1Q76N89 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
HECW1Q76N89 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.93■■■□□ 2.54
HECW1Q76N89 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC30.93■■■□□ 2.54
HECW1Q76N89 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC30.93■■■□□ 2.54
HECW1Q76N89 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC30.93■■■□□ 2.54
HECW1Q76N89 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC30.93■■■□□ 2.54
HECW1Q76N89 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
HECW1Q76N89 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
HECW1Q76N89 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
HECW1Q76N89 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC30.92■■■□□ 2.54
HECW1Q76N89 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC30.92■■■□□ 2.54
HECW1Q76N89 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC30.92■■■□□ 2.54
HECW1Q76N89 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC30.92■■■□□ 2.54
HECW1Q76N89 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
HECW1Q76N89 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC30.92■■■□□ 2.54
HECW1Q76N89 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
HECW1Q76N89 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.92■■■□□ 2.54
HECW1Q76N89 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC30.92■■■□□ 2.54
HECW1Q76N89 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC30.92■■■□□ 2.54
HECW1Q76N89 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC30.92■■■□□ 2.54
HECW1Q76N89 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC30.92■■■□□ 2.54
HECW1Q76N89 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC30.92■■■□□ 2.54
HECW1Q76N89 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.92■■■□□ 2.54
HECW1Q76N89 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC30.92■■■□□ 2.54
HECW1Q76N89 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC30.91■■■□□ 2.54
HECW1Q76N89 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
HECW1Q76N89 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC30.91■■■□□ 2.54
HECW1Q76N89 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
HECW1Q76N89 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
HECW1Q76N89 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.91■■■□□ 2.54
HECW1Q76N89 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
HECW1Q76N89 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.91■■■□□ 2.54
HECW1Q76N89 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC30.91■■■□□ 2.54
HECW1Q76N89 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC30.91■■■□□ 2.54
HECW1Q76N89 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
HECW1Q76N89 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC30.91■■■□□ 2.54
HECW1Q76N89 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
HECW1Q76N89 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
HECW1Q76N89 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC30.9■■■□□ 2.54
HECW1Q76N89 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
HECW1Q76N89 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC30.9■■■□□ 2.54
HECW1Q76N89 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC30.9■■■□□ 2.54
HECW1Q76N89 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC30.9■■■□□ 2.54
HECW1Q76N89 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC30.9■■■□□ 2.54
HECW1Q76N89 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.9■■■□□ 2.54
HECW1Q76N89 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
HECW1Q76N89 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.9■■■□□ 2.54
HECW1Q76N89 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC30.9■■■□□ 2.54
HECW1Q76N89 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
HECW1Q76N89 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.89■■■□□ 2.54
HECW1Q76N89 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.89■■■□□ 2.54
HECW1Q76N89 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
HECW1Q76N89 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
HECW1Q76N89 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC30.89■■■□□ 2.54
HECW1Q76N89 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
HECW1Q76N89 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC30.89■■■□□ 2.54
HECW1Q76N89 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
HECW1Q76N89 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC30.89■■■□□ 2.54
HECW1Q76N89 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC30.89■■■□□ 2.54
HECW1Q76N89 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
HECW1Q76N89 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
HECW1Q76N89 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC30.89■■■□□ 2.54
HECW1Q76N89 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.89■■■□□ 2.54
HECW1Q76N89 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC30.89■■■□□ 2.53
HECW1Q76N89 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.89■■■□□ 2.53
HECW1Q76N89 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.53
HECW1Q76N89 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
HECW1Q76N89 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
HECW1Q76N89 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC30.88■■■□□ 2.53
HECW1Q76N89 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
HECW1Q76N89 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC30.88■■■□□ 2.53
HECW1Q76N89 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.88■■■□□ 2.53
HECW1Q76N89 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC30.88■■■□□ 2.53
HECW1Q76N89 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC30.88■■■□□ 2.53
HECW1Q76N89 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
HECW1Q76N89 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
HECW1Q76N89 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
HECW1Q76N89 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.9 ms