Protein–RNA interactions for Protein: Q71RS6

SLC24A5, Sodium/potassium/calcium exchanger 5, humanhuman

Predictions only

Length 500 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC24A5Q71RS6 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC24A5Q71RS6 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC24A5Q71RS6 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC24A5Q71RS6 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC24A5Q71RS6 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC24A5Q71RS6 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC24A5Q71RS6 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC24A5Q71RS6 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC24A5Q71RS6 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC24A5Q71RS6 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC24A5Q71RS6 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC24A5Q71RS6 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC24A5Q71RS6 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC24A5Q71RS6 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC24A5Q71RS6 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SLC24A5Q71RS6 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC24A5Q71RS6 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC24A5Q71RS6 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC24A5Q71RS6 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC24A5Q71RS6 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC24A5Q71RS6 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC24A5Q71RS6 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC24A5Q71RS6 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC24A5Q71RS6 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC24A5Q71RS6 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC24A5Q71RS6 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC24A5Q71RS6 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC24A5Q71RS6 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC24A5Q71RS6 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC24A5Q71RS6 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC24A5Q71RS6 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC24A5Q71RS6 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC24A5Q71RS6 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC24A5Q71RS6 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC24A5Q71RS6 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SLC24A5Q71RS6 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC24A5Q71RS6 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC24A5Q71RS6 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC24A5Q71RS6 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC24A5Q71RS6 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC24A5Q71RS6 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC24A5Q71RS6 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC24A5Q71RS6 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC24A5Q71RS6 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC24A5Q71RS6 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC24A5Q71RS6 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC24A5Q71RS6 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC24A5Q71RS6 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC24A5Q71RS6 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC24A5Q71RS6 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC24A5Q71RS6 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SLC24A5Q71RS6 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC24A5Q71RS6 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC24A5Q71RS6 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC24A5Q71RS6 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC24A5Q71RS6 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC24A5Q71RS6 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC24A5Q71RS6 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC24A5Q71RS6 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC24A5Q71RS6 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC24A5Q71RS6 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC24A5Q71RS6 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC24A5Q71RS6 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC24A5Q71RS6 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC24A5Q71RS6 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC24A5Q71RS6 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC24A5Q71RS6 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC24A5Q71RS6 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC24A5Q71RS6 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC24A5Q71RS6 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC24A5Q71RS6 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC24A5Q71RS6 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SLC24A5Q71RS6 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SLC24A5Q71RS6 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SLC24A5Q71RS6 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SLC24A5Q71RS6 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SLC24A5Q71RS6 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC24A5Q71RS6 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC24A5Q71RS6 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC24A5Q71RS6 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC24A5Q71RS6 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC24A5Q71RS6 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC24A5Q71RS6 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC24A5Q71RS6 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC24A5Q71RS6 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC24A5Q71RS6 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SLC24A5Q71RS6 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC24A5Q71RS6 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC24A5Q71RS6 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC24A5Q71RS6 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC24A5Q71RS6 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC24A5Q71RS6 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC24A5Q71RS6 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC24A5Q71RS6 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC24A5Q71RS6 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC24A5Q71RS6 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC24A5Q71RS6 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SLC24A5Q71RS6 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC24A5Q71RS6 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SLC24A5Q71RS6 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms