Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSI9

CAPN12, Calpain-12, humanhuman

Predictions only

Length 719 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN12Q6ZSI9 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CAPN12Q6ZSI9 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CAPN12Q6ZSI9 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CAPN12Q6ZSI9 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CAPN12Q6ZSI9 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CAPN12Q6ZSI9 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CAPN12Q6ZSI9 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CAPN12Q6ZSI9 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CAPN12Q6ZSI9 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CAPN12Q6ZSI9 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CAPN12Q6ZSI9 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CAPN12Q6ZSI9 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CAPN12Q6ZSI9 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CAPN12Q6ZSI9 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CAPN12Q6ZSI9 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CAPN12Q6ZSI9 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CAPN12Q6ZSI9 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CAPN12Q6ZSI9 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CAPN12Q6ZSI9 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CAPN12Q6ZSI9 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CAPN12Q6ZSI9 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CAPN12Q6ZSI9 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CAPN12Q6ZSI9 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CAPN12Q6ZSI9 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CAPN12Q6ZSI9 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CAPN12Q6ZSI9 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CAPN12Q6ZSI9 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CAPN12Q6ZSI9 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CAPN12Q6ZSI9 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CAPN12Q6ZSI9 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CAPN12Q6ZSI9 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CAPN12Q6ZSI9 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CAPN12Q6ZSI9 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CAPN12Q6ZSI9 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CAPN12Q6ZSI9 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CAPN12Q6ZSI9 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CAPN12Q6ZSI9 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CAPN12Q6ZSI9 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CAPN12Q6ZSI9 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CAPN12Q6ZSI9 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CAPN12Q6ZSI9 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
CAPN12Q6ZSI9 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CAPN12Q6ZSI9 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CAPN12Q6ZSI9 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CAPN12Q6ZSI9 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CAPN12Q6ZSI9 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CAPN12Q6ZSI9 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CAPN12Q6ZSI9 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CAPN12Q6ZSI9 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CAPN12Q6ZSI9 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CAPN12Q6ZSI9 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
CAPN12Q6ZSI9 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CAPN12Q6ZSI9 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CAPN12Q6ZSI9 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CAPN12Q6ZSI9 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CAPN12Q6ZSI9 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CAPN12Q6ZSI9 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CAPN12Q6ZSI9 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CAPN12Q6ZSI9 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CAPN12Q6ZSI9 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CAPN12Q6ZSI9 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CAPN12Q6ZSI9 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CAPN12Q6ZSI9 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CAPN12Q6ZSI9 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CAPN12Q6ZSI9 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CAPN12Q6ZSI9 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CAPN12Q6ZSI9 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CAPN12Q6ZSI9 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CAPN12Q6ZSI9 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CAPN12Q6ZSI9 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CAPN12Q6ZSI9 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CAPN12Q6ZSI9 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CAPN12Q6ZSI9 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CAPN12Q6ZSI9 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CAPN12Q6ZSI9 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CAPN12Q6ZSI9 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
CAPN12Q6ZSI9 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CAPN12Q6ZSI9 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CAPN12Q6ZSI9 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CAPN12Q6ZSI9 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
CAPN12Q6ZSI9 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CAPN12Q6ZSI9 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CAPN12Q6ZSI9 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CAPN12Q6ZSI9 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CAPN12Q6ZSI9 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CAPN12Q6ZSI9 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CAPN12Q6ZSI9 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CAPN12Q6ZSI9 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CAPN12Q6ZSI9 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CAPN12Q6ZSI9 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CAPN12Q6ZSI9 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CAPN12Q6ZSI9 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CAPN12Q6ZSI9 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CAPN12Q6ZSI9 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CAPN12Q6ZSI9 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CAPN12Q6ZSI9 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CAPN12Q6ZSI9 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CAPN12Q6ZSI9 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CAPN12Q6ZSI9 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CAPN12Q6ZSI9 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms