Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRS2

SRCAP, Helicase SRCAP, humanhuman

Predictions only

Length 3,230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRCAPQ6ZRS2 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
SRCAPQ6ZRS2 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SRCAPQ6ZRS2 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SRCAPQ6ZRS2 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
SRCAPQ6ZRS2 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SRCAPQ6ZRS2 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SRCAPQ6ZRS2 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SRCAPQ6ZRS2 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SRCAPQ6ZRS2 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SRCAPQ6ZRS2 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SRCAPQ6ZRS2 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SRCAPQ6ZRS2 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
SRCAPQ6ZRS2 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SRCAPQ6ZRS2 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SRCAPQ6ZRS2 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SRCAPQ6ZRS2 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SRCAPQ6ZRS2 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SRCAPQ6ZRS2 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SRCAPQ6ZRS2 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SRCAPQ6ZRS2 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SRCAPQ6ZRS2 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SRCAPQ6ZRS2 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SRCAPQ6ZRS2 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SRCAPQ6ZRS2 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SRCAPQ6ZRS2 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SRCAPQ6ZRS2 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SRCAPQ6ZRS2 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SRCAPQ6ZRS2 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SRCAPQ6ZRS2 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SRCAPQ6ZRS2 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
SRCAPQ6ZRS2 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
SRCAPQ6ZRS2 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SRCAPQ6ZRS2 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SRCAPQ6ZRS2 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SRCAPQ6ZRS2 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SRCAPQ6ZRS2 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SRCAPQ6ZRS2 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
SRCAPQ6ZRS2 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SRCAPQ6ZRS2 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SRCAPQ6ZRS2 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SRCAPQ6ZRS2 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SRCAPQ6ZRS2 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
SRCAPQ6ZRS2 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SRCAPQ6ZRS2 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SRCAPQ6ZRS2 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SRCAPQ6ZRS2 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SRCAPQ6ZRS2 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SRCAPQ6ZRS2 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SRCAPQ6ZRS2 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SRCAPQ6ZRS2 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SRCAPQ6ZRS2 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SRCAPQ6ZRS2 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SRCAPQ6ZRS2 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SRCAPQ6ZRS2 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SRCAPQ6ZRS2 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SRCAPQ6ZRS2 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
SRCAPQ6ZRS2 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
SRCAPQ6ZRS2 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SRCAPQ6ZRS2 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
SRCAPQ6ZRS2 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
SRCAPQ6ZRS2 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
SRCAPQ6ZRS2 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SRCAPQ6ZRS2 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SRCAPQ6ZRS2 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SRCAPQ6ZRS2 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.61
SRCAPQ6ZRS2 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
SRCAPQ6ZRS2 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
SRCAPQ6ZRS2 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
SRCAPQ6ZRS2 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
SRCAPQ6ZRS2 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SRCAPQ6ZRS2 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SRCAPQ6ZRS2 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
SRCAPQ6ZRS2 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SRCAPQ6ZRS2 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
SRCAPQ6ZRS2 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SRCAPQ6ZRS2 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
SRCAPQ6ZRS2 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SRCAPQ6ZRS2 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SRCAPQ6ZRS2 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SRCAPQ6ZRS2 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SRCAPQ6ZRS2 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
SRCAPQ6ZRS2 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SRCAPQ6ZRS2 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SRCAPQ6ZRS2 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SRCAPQ6ZRS2 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SRCAPQ6ZRS2 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SRCAPQ6ZRS2 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SRCAPQ6ZRS2 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SRCAPQ6ZRS2 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
SRCAPQ6ZRS2 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SRCAPQ6ZRS2 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
SRCAPQ6ZRS2 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SRCAPQ6ZRS2 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SRCAPQ6ZRS2 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SRCAPQ6ZRS2 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SRCAPQ6ZRS2 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SRCAPQ6ZRS2 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SRCAPQ6ZRS2 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SRCAPQ6ZRS2 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SRCAPQ6ZRS2 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms