Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRK6

CCDC73, Coiled-coil domain-containing protein 73, humanhuman

Predictions only

Length 1,079 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC73Q6ZRK6 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC73Q6ZRK6 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CCDC73Q6ZRK6 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC73Q6ZRK6 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC73Q6ZRK6 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC73Q6ZRK6 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC73Q6ZRK6 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC73Q6ZRK6 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC73Q6ZRK6 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC73Q6ZRK6 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC73Q6ZRK6 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC73Q6ZRK6 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC73Q6ZRK6 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC73Q6ZRK6 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC73Q6ZRK6 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC73Q6ZRK6 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC73Q6ZRK6 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC73Q6ZRK6 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC73Q6ZRK6 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC73Q6ZRK6 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC73Q6ZRK6 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC73Q6ZRK6 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC73Q6ZRK6 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC73Q6ZRK6 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC73Q6ZRK6 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC73Q6ZRK6 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC73Q6ZRK6 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC73Q6ZRK6 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CCDC73Q6ZRK6 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC73Q6ZRK6 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC73Q6ZRK6 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC73Q6ZRK6 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC73Q6ZRK6 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC73Q6ZRK6 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC73Q6ZRK6 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC73Q6ZRK6 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC73Q6ZRK6 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC73Q6ZRK6 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC73Q6ZRK6 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC73Q6ZRK6 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC73Q6ZRK6 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC73Q6ZRK6 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC73Q6ZRK6 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CCDC73Q6ZRK6 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC73Q6ZRK6 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC73Q6ZRK6 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC73Q6ZRK6 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC73Q6ZRK6 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC73Q6ZRK6 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC73Q6ZRK6 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC73Q6ZRK6 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC73Q6ZRK6 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC73Q6ZRK6 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC73Q6ZRK6 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC73Q6ZRK6 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC73Q6ZRK6 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CCDC73Q6ZRK6 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
CCDC73Q6ZRK6 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
CCDC73Q6ZRK6 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CCDC73Q6ZRK6 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
CCDC73Q6ZRK6 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CCDC73Q6ZRK6 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
CCDC73Q6ZRK6 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC73Q6ZRK6 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC73Q6ZRK6 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC73Q6ZRK6 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC73Q6ZRK6 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC73Q6ZRK6 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC73Q6ZRK6 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC73Q6ZRK6 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC73Q6ZRK6 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC73Q6ZRK6 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC73Q6ZRK6 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC73Q6ZRK6 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC73Q6ZRK6 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC73Q6ZRK6 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC73Q6ZRK6 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC73Q6ZRK6 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC73Q6ZRK6 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC73Q6ZRK6 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC73Q6ZRK6 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC73Q6ZRK6 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC73Q6ZRK6 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC73Q6ZRK6 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC73Q6ZRK6 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC73Q6ZRK6 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC73Q6ZRK6 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC73Q6ZRK6 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC73Q6ZRK6 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC73Q6ZRK6 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC73Q6ZRK6 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC73Q6ZRK6 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC73Q6ZRK6 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC73Q6ZRK6 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC73Q6ZRK6 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC73Q6ZRK6 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC73Q6ZRK6 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC73Q6ZRK6 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC73Q6ZRK6 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC73Q6ZRK6 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms