Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMY3

SPOCD1, SPOC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCD1Q6ZMY3 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SPOCD1Q6ZMY3 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SPOCD1Q6ZMY3 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SPOCD1Q6ZMY3 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SPOCD1Q6ZMY3 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
SPOCD1Q6ZMY3 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
SPOCD1Q6ZMY3 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SPOCD1Q6ZMY3 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SPOCD1Q6ZMY3 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
SPOCD1Q6ZMY3 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SPOCD1Q6ZMY3 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SPOCD1Q6ZMY3 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SPOCD1Q6ZMY3 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SPOCD1Q6ZMY3 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SPOCD1Q6ZMY3 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SPOCD1Q6ZMY3 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SPOCD1Q6ZMY3 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SPOCD1Q6ZMY3 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SPOCD1Q6ZMY3 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
SPOCD1Q6ZMY3 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SPOCD1Q6ZMY3 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
SPOCD1Q6ZMY3 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
SPOCD1Q6ZMY3 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SPOCD1Q6ZMY3 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SPOCD1Q6ZMY3 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SPOCD1Q6ZMY3 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
SPOCD1Q6ZMY3 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
SPOCD1Q6ZMY3 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SPOCD1Q6ZMY3 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
SPOCD1Q6ZMY3 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SPOCD1Q6ZMY3 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SPOCD1Q6ZMY3 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SPOCD1Q6ZMY3 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SPOCD1Q6ZMY3 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SPOCD1Q6ZMY3 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SPOCD1Q6ZMY3 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SPOCD1Q6ZMY3 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SPOCD1Q6ZMY3 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SPOCD1Q6ZMY3 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
SPOCD1Q6ZMY3 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
SPOCD1Q6ZMY3 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
SPOCD1Q6ZMY3 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SPOCD1Q6ZMY3 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SPOCD1Q6ZMY3 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
SPOCD1Q6ZMY3 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SPOCD1Q6ZMY3 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SPOCD1Q6ZMY3 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
SPOCD1Q6ZMY3 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SPOCD1Q6ZMY3 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.88
SPOCD1Q6ZMY3 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
SPOCD1Q6ZMY3 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SPOCD1Q6ZMY3 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SPOCD1Q6ZMY3 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SPOCD1Q6ZMY3 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SPOCD1Q6ZMY3 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SPOCD1Q6ZMY3 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
SPOCD1Q6ZMY3 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.88
SPOCD1Q6ZMY3 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.88
SPOCD1Q6ZMY3 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SPOCD1Q6ZMY3 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SPOCD1Q6ZMY3 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SPOCD1Q6ZMY3 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SPOCD1Q6ZMY3 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SPOCD1Q6ZMY3 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SPOCD1Q6ZMY3 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SPOCD1Q6ZMY3 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SPOCD1Q6ZMY3 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SPOCD1Q6ZMY3 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SPOCD1Q6ZMY3 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SPOCD1Q6ZMY3 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SPOCD1Q6ZMY3 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
SPOCD1Q6ZMY3 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SPOCD1Q6ZMY3 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SPOCD1Q6ZMY3 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SPOCD1Q6ZMY3 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SPOCD1Q6ZMY3 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SPOCD1Q6ZMY3 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SPOCD1Q6ZMY3 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
SPOCD1Q6ZMY3 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SPOCD1Q6ZMY3 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SPOCD1Q6ZMY3 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
SPOCD1Q6ZMY3 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SPOCD1Q6ZMY3 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SPOCD1Q6ZMY3 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SPOCD1Q6ZMY3 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SPOCD1Q6ZMY3 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SPOCD1Q6ZMY3 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SPOCD1Q6ZMY3 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SPOCD1Q6ZMY3 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SPOCD1Q6ZMY3 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
SPOCD1Q6ZMY3 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
SPOCD1Q6ZMY3 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SPOCD1Q6ZMY3 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SPOCD1Q6ZMY3 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SPOCD1Q6ZMY3 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SPOCD1Q6ZMY3 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
SPOCD1Q6ZMY3 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
SPOCD1Q6ZMY3 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SPOCD1Q6ZMY3 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SPOCD1Q6ZMY3 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56 ms