Protein–RNA interactions for Protein: Q6TDU7

CASC1, Protein CASC1, humanhuman

Predictions only

Length 716 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASC1Q6TDU7 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CASC1Q6TDU7 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CASC1Q6TDU7 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CASC1Q6TDU7 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CASC1Q6TDU7 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CASC1Q6TDU7 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CASC1Q6TDU7 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CASC1Q6TDU7 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CASC1Q6TDU7 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CASC1Q6TDU7 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CASC1Q6TDU7 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CASC1Q6TDU7 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CASC1Q6TDU7 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CASC1Q6TDU7 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CASC1Q6TDU7 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CASC1Q6TDU7 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CASC1Q6TDU7 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CASC1Q6TDU7 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CASC1Q6TDU7 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CASC1Q6TDU7 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CASC1Q6TDU7 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CASC1Q6TDU7 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CASC1Q6TDU7 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CASC1Q6TDU7 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CASC1Q6TDU7 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CASC1Q6TDU7 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CASC1Q6TDU7 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CASC1Q6TDU7 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CASC1Q6TDU7 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CASC1Q6TDU7 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CASC1Q6TDU7 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CASC1Q6TDU7 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CASC1Q6TDU7 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CASC1Q6TDU7 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CASC1Q6TDU7 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CASC1Q6TDU7 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CASC1Q6TDU7 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CASC1Q6TDU7 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CASC1Q6TDU7 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CASC1Q6TDU7 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CASC1Q6TDU7 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CASC1Q6TDU7 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CASC1Q6TDU7 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CASC1Q6TDU7 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CASC1Q6TDU7 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CASC1Q6TDU7 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CASC1Q6TDU7 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CASC1Q6TDU7 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CASC1Q6TDU7 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
CASC1Q6TDU7 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.47
CASC1Q6TDU7 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CASC1Q6TDU7 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CASC1Q6TDU7 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CASC1Q6TDU7 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CASC1Q6TDU7 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CASC1Q6TDU7 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CASC1Q6TDU7 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CASC1Q6TDU7 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CASC1Q6TDU7 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CASC1Q6TDU7 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CASC1Q6TDU7 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CASC1Q6TDU7 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CASC1Q6TDU7 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CASC1Q6TDU7 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CASC1Q6TDU7 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CASC1Q6TDU7 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CASC1Q6TDU7 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CASC1Q6TDU7 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CASC1Q6TDU7 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CASC1Q6TDU7 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CASC1Q6TDU7 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CASC1Q6TDU7 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CASC1Q6TDU7 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CASC1Q6TDU7 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CASC1Q6TDU7 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CASC1Q6TDU7 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CASC1Q6TDU7 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CASC1Q6TDU7 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CASC1Q6TDU7 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
CASC1Q6TDU7 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CASC1Q6TDU7 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CASC1Q6TDU7 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CASC1Q6TDU7 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CASC1Q6TDU7 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CASC1Q6TDU7 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CASC1Q6TDU7 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CASC1Q6TDU7 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CASC1Q6TDU7 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CASC1Q6TDU7 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CASC1Q6TDU7 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CASC1Q6TDU7 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CASC1Q6TDU7 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CASC1Q6TDU7 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CASC1Q6TDU7 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CASC1Q6TDU7 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CASC1Q6TDU7 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CASC1Q6TDU7 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CASC1Q6TDU7 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CASC1Q6TDU7 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CASC1Q6TDU7 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms