Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1M0

SLC27A4, Long-chain fatty acid transport protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC27A4Q6P1M0 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC27A4Q6P1M0 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
SLC27A4Q6P1M0 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC27A4Q6P1M0 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC27A4Q6P1M0 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC27A4Q6P1M0 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC27A4Q6P1M0 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC27A4Q6P1M0 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC27A4Q6P1M0 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC27A4Q6P1M0 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC27A4Q6P1M0 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC27A4Q6P1M0 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC27A4Q6P1M0 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC27A4Q6P1M0 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC27A4Q6P1M0 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC27A4Q6P1M0 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC27A4Q6P1M0 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC27A4Q6P1M0 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC27A4Q6P1M0 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC27A4Q6P1M0 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC27A4Q6P1M0 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC27A4Q6P1M0 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
SLC27A4Q6P1M0 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SLC27A4Q6P1M0 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SLC27A4Q6P1M0 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SLC27A4Q6P1M0 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SLC27A4Q6P1M0 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SLC27A4Q6P1M0 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SLC27A4Q6P1M0 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SLC27A4Q6P1M0 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SLC27A4Q6P1M0 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC27A4Q6P1M0 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC27A4Q6P1M0 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC27A4Q6P1M0 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC27A4Q6P1M0 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC27A4Q6P1M0 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC27A4Q6P1M0 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC27A4Q6P1M0 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC27A4Q6P1M0 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC27A4Q6P1M0 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC27A4Q6P1M0 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC27A4Q6P1M0 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC27A4Q6P1M0 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC27A4Q6P1M0 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC27A4Q6P1M0 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC27A4Q6P1M0 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC27A4Q6P1M0 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC27A4Q6P1M0 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC27A4Q6P1M0 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC27A4Q6P1M0 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC27A4Q6P1M0 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC27A4Q6P1M0 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC27A4Q6P1M0 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC27A4Q6P1M0 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC27A4Q6P1M0 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC27A4Q6P1M0 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC27A4Q6P1M0 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC27A4Q6P1M0 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC27A4Q6P1M0 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC27A4Q6P1M0 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC27A4Q6P1M0 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC27A4Q6P1M0 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC27A4Q6P1M0 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SLC27A4Q6P1M0 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLC27A4Q6P1M0 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SLC27A4Q6P1M0 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SLC27A4Q6P1M0 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SLC27A4Q6P1M0 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SLC27A4Q6P1M0 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLC27A4Q6P1M0 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SLC27A4Q6P1M0 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SLC27A4Q6P1M0 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SLC27A4Q6P1M0 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLC27A4Q6P1M0 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SLC27A4Q6P1M0 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLC27A4Q6P1M0 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLC27A4Q6P1M0 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
SLC27A4Q6P1M0 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SLC27A4Q6P1M0 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLC27A4Q6P1M0 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SLC27A4Q6P1M0 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLC27A4Q6P1M0 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SLC27A4Q6P1M0 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLC27A4Q6P1M0 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLC27A4Q6P1M0 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLC27A4Q6P1M0 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
SLC27A4Q6P1M0 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SLC27A4Q6P1M0 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLC27A4Q6P1M0 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SLC27A4Q6P1M0 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLC27A4Q6P1M0 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLC27A4Q6P1M0 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC27A4Q6P1M0 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC27A4Q6P1M0 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC27A4Q6P1M0 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC27A4Q6P1M0 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC27A4Q6P1M0 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC27A4Q6P1M0 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC27A4Q6P1M0 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC27A4Q6P1M0 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms