Protein–RNA interactions for Protein: Q6NWY9

PRPF40B, Pre-mRNA-processing factor 40 homolog B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 871 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF40BQ6NWY9 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PRPF40BQ6NWY9 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PRPF40BQ6NWY9 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PRPF40BQ6NWY9 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PRPF40BQ6NWY9 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PRPF40BQ6NWY9 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PRPF40BQ6NWY9 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PRPF40BQ6NWY9 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PRPF40BQ6NWY9 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
PRPF40BQ6NWY9 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PRPF40BQ6NWY9 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PRPF40BQ6NWY9 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PRPF40BQ6NWY9 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PRPF40BQ6NWY9 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PRPF40BQ6NWY9 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
PRPF40BQ6NWY9 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PRPF40BQ6NWY9 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PRPF40BQ6NWY9 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PRPF40BQ6NWY9 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PRPF40BQ6NWY9 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PRPF40BQ6NWY9 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
PRPF40BQ6NWY9 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PRPF40BQ6NWY9 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PRPF40BQ6NWY9 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PRPF40BQ6NWY9 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PRPF40BQ6NWY9 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PRPF40BQ6NWY9 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PRPF40BQ6NWY9 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PRPF40BQ6NWY9 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PRPF40BQ6NWY9 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
PRPF40BQ6NWY9 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PRPF40BQ6NWY9 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PRPF40BQ6NWY9 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PRPF40BQ6NWY9 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
PRPF40BQ6NWY9 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PRPF40BQ6NWY9 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
PRPF40BQ6NWY9 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PRPF40BQ6NWY9 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PRPF40BQ6NWY9 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PRPF40BQ6NWY9 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PRPF40BQ6NWY9 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
PRPF40BQ6NWY9 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
PRPF40BQ6NWY9 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PRPF40BQ6NWY9 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PRPF40BQ6NWY9 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PRPF40BQ6NWY9 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PRPF40BQ6NWY9 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PRPF40BQ6NWY9 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PRPF40BQ6NWY9 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PRPF40BQ6NWY9 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PRPF40BQ6NWY9 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PRPF40BQ6NWY9 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PRPF40BQ6NWY9 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PRPF40BQ6NWY9 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PRPF40BQ6NWY9 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PRPF40BQ6NWY9 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PRPF40BQ6NWY9 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PRPF40BQ6NWY9 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PRPF40BQ6NWY9 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PRPF40BQ6NWY9 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PRPF40BQ6NWY9 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PRPF40BQ6NWY9 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PRPF40BQ6NWY9 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
PRPF40BQ6NWY9 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
PRPF40BQ6NWY9 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PRPF40BQ6NWY9 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PRPF40BQ6NWY9 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PRPF40BQ6NWY9 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PRPF40BQ6NWY9 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PRPF40BQ6NWY9 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PRPF40BQ6NWY9 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PRPF40BQ6NWY9 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PRPF40BQ6NWY9 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PRPF40BQ6NWY9 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PRPF40BQ6NWY9 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PRPF40BQ6NWY9 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PRPF40BQ6NWY9 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PRPF40BQ6NWY9 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PRPF40BQ6NWY9 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PRPF40BQ6NWY9 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PRPF40BQ6NWY9 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PRPF40BQ6NWY9 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PRPF40BQ6NWY9 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PRPF40BQ6NWY9 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PRPF40BQ6NWY9 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
PRPF40BQ6NWY9 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PRPF40BQ6NWY9 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PRPF40BQ6NWY9 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PRPF40BQ6NWY9 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
PRPF40BQ6NWY9 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PRPF40BQ6NWY9 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PRPF40BQ6NWY9 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PRPF40BQ6NWY9 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
PRPF40BQ6NWY9 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PRPF40BQ6NWY9 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
PRPF40BQ6NWY9 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PRPF40BQ6NWY9 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PRPF40BQ6NWY9 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PRPF40BQ6NWY9 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PRPF40BQ6NWY9 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms