Protein–RNA interactions for Protein: Q6IQ19

CCSAP, Centriole, cilia and spindle-associated protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAPQ6IQ19 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCSAPQ6IQ19 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCSAPQ6IQ19 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCSAPQ6IQ19 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCSAPQ6IQ19 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCSAPQ6IQ19 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCSAPQ6IQ19 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCSAPQ6IQ19 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CCSAPQ6IQ19 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCSAPQ6IQ19 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCSAPQ6IQ19 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CCSAPQ6IQ19 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCSAPQ6IQ19 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCSAPQ6IQ19 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCSAPQ6IQ19 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCSAPQ6IQ19 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CCSAPQ6IQ19 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
CCSAPQ6IQ19 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CCSAPQ6IQ19 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CCSAPQ6IQ19 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CCSAPQ6IQ19 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CCSAPQ6IQ19 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
CCSAPQ6IQ19 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CCSAPQ6IQ19 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCSAPQ6IQ19 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCSAPQ6IQ19 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCSAPQ6IQ19 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCSAPQ6IQ19 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCSAPQ6IQ19 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCSAPQ6IQ19 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCSAPQ6IQ19 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCSAPQ6IQ19 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCSAPQ6IQ19 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CCSAPQ6IQ19 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCSAPQ6IQ19 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCSAPQ6IQ19 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCSAPQ6IQ19 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CCSAPQ6IQ19 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CCSAPQ6IQ19 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCSAPQ6IQ19 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CCSAPQ6IQ19 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCSAPQ6IQ19 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CCSAPQ6IQ19 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCSAPQ6IQ19 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCSAPQ6IQ19 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CCSAPQ6IQ19 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCSAPQ6IQ19 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CCSAPQ6IQ19 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CCSAPQ6IQ19 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCSAPQ6IQ19 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCSAPQ6IQ19 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCSAPQ6IQ19 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CCSAPQ6IQ19 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCSAPQ6IQ19 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CCSAPQ6IQ19 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCSAPQ6IQ19 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCSAPQ6IQ19 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCSAPQ6IQ19 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCSAPQ6IQ19 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCSAPQ6IQ19 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCSAPQ6IQ19 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCSAPQ6IQ19 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCSAPQ6IQ19 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCSAPQ6IQ19 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCSAPQ6IQ19 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCSAPQ6IQ19 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCSAPQ6IQ19 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CCSAPQ6IQ19 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCSAPQ6IQ19 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCSAPQ6IQ19 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCSAPQ6IQ19 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCSAPQ6IQ19 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCSAPQ6IQ19 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCSAPQ6IQ19 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCSAPQ6IQ19 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCSAPQ6IQ19 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCSAPQ6IQ19 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCSAPQ6IQ19 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CCSAPQ6IQ19 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC21.95■■□□□ 1.11
CCSAPQ6IQ19 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCSAPQ6IQ19 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
CCSAPQ6IQ19 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCSAPQ6IQ19 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCSAPQ6IQ19 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCSAPQ6IQ19 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCSAPQ6IQ19 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
CCSAPQ6IQ19 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCSAPQ6IQ19 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCSAPQ6IQ19 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCSAPQ6IQ19 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
CCSAPQ6IQ19 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCSAPQ6IQ19 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
CCSAPQ6IQ19 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCSAPQ6IQ19 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCSAPQ6IQ19 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCSAPQ6IQ19 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCSAPQ6IQ19 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
CCSAPQ6IQ19 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCSAPQ6IQ19 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCSAPQ6IQ19 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms