Protein–RNA interactions for Protein: Q6IC98

GRAMD4, GRAM domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRAMD4Q6IC98 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GRAMD4Q6IC98 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GRAMD4Q6IC98 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
GRAMD4Q6IC98 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GRAMD4Q6IC98 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GRAMD4Q6IC98 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GRAMD4Q6IC98 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GRAMD4Q6IC98 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GRAMD4Q6IC98 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
GRAMD4Q6IC98 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GRAMD4Q6IC98 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GRAMD4Q6IC98 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GRAMD4Q6IC98 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GRAMD4Q6IC98 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GRAMD4Q6IC98 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GRAMD4Q6IC98 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GRAMD4Q6IC98 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GRAMD4Q6IC98 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GRAMD4Q6IC98 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GRAMD4Q6IC98 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GRAMD4Q6IC98 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GRAMD4Q6IC98 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GRAMD4Q6IC98 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GRAMD4Q6IC98 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GRAMD4Q6IC98 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GRAMD4Q6IC98 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
GRAMD4Q6IC98 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
GRAMD4Q6IC98 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GRAMD4Q6IC98 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GRAMD4Q6IC98 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GRAMD4Q6IC98 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GRAMD4Q6IC98 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GRAMD4Q6IC98 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GRAMD4Q6IC98 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GRAMD4Q6IC98 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GRAMD4Q6IC98 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GRAMD4Q6IC98 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GRAMD4Q6IC98 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
GRAMD4Q6IC98 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GRAMD4Q6IC98 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GRAMD4Q6IC98 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GRAMD4Q6IC98 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
GRAMD4Q6IC98 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GRAMD4Q6IC98 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
GRAMD4Q6IC98 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GRAMD4Q6IC98 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GRAMD4Q6IC98 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GRAMD4Q6IC98 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GRAMD4Q6IC98 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GRAMD4Q6IC98 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GRAMD4Q6IC98 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GRAMD4Q6IC98 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GRAMD4Q6IC98 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GRAMD4Q6IC98 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GRAMD4Q6IC98 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GRAMD4Q6IC98 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
GRAMD4Q6IC98 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
GRAMD4Q6IC98 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GRAMD4Q6IC98 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GRAMD4Q6IC98 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GRAMD4Q6IC98 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
GRAMD4Q6IC98 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GRAMD4Q6IC98 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
GRAMD4Q6IC98 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GRAMD4Q6IC98 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GRAMD4Q6IC98 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GRAMD4Q6IC98 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
GRAMD4Q6IC98 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
GRAMD4Q6IC98 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
GRAMD4Q6IC98 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GRAMD4Q6IC98 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GRAMD4Q6IC98 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GRAMD4Q6IC98 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
GRAMD4Q6IC98 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GRAMD4Q6IC98 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GRAMD4Q6IC98 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GRAMD4Q6IC98 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GRAMD4Q6IC98 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GRAMD4Q6IC98 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GRAMD4Q6IC98 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
GRAMD4Q6IC98 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GRAMD4Q6IC98 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GRAMD4Q6IC98 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GRAMD4Q6IC98 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GRAMD4Q6IC98 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
GRAMD4Q6IC98 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
GRAMD4Q6IC98 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
GRAMD4Q6IC98 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
GRAMD4Q6IC98 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GRAMD4Q6IC98 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GRAMD4Q6IC98 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GRAMD4Q6IC98 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GRAMD4Q6IC98 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GRAMD4Q6IC98 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GRAMD4Q6IC98 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GRAMD4Q6IC98 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GRAMD4Q6IC98 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GRAMD4Q6IC98 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
GRAMD4Q6IC98 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
GRAMD4Q6IC98 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms