Protein–RNA interactions for Protein: Q6DN14

MCTP1, Multiple C2 and transmembrane domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 999 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCTP1Q6DN14 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
MCTP1Q6DN14 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
MCTP1Q6DN14 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
MCTP1Q6DN14 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
MCTP1Q6DN14 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MCTP1Q6DN14 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MCTP1Q6DN14 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MCTP1Q6DN14 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MCTP1Q6DN14 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MCTP1Q6DN14 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MCTP1Q6DN14 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MCTP1Q6DN14 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MCTP1Q6DN14 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MCTP1Q6DN14 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MCTP1Q6DN14 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
MCTP1Q6DN14 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
MCTP1Q6DN14 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
MCTP1Q6DN14 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
MCTP1Q6DN14 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
MCTP1Q6DN14 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
MCTP1Q6DN14 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MCTP1Q6DN14 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
MCTP1Q6DN14 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
MCTP1Q6DN14 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
MCTP1Q6DN14 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
MCTP1Q6DN14 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
MCTP1Q6DN14 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MCTP1Q6DN14 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
MCTP1Q6DN14 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
MCTP1Q6DN14 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
MCTP1Q6DN14 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
MCTP1Q6DN14 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MCTP1Q6DN14 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MCTP1Q6DN14 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MCTP1Q6DN14 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MCTP1Q6DN14 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MCTP1Q6DN14 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MCTP1Q6DN14 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MCTP1Q6DN14 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
MCTP1Q6DN14 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MCTP1Q6DN14 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
MCTP1Q6DN14 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MCTP1Q6DN14 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MCTP1Q6DN14 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MCTP1Q6DN14 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MCTP1Q6DN14 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MCTP1Q6DN14 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MCTP1Q6DN14 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MCTP1Q6DN14 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MCTP1Q6DN14 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MCTP1Q6DN14 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MCTP1Q6DN14 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MCTP1Q6DN14 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MCTP1Q6DN14 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MCTP1Q6DN14 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MCTP1Q6DN14 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MCTP1Q6DN14 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MCTP1Q6DN14 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
MCTP1Q6DN14 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MCTP1Q6DN14 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MCTP1Q6DN14 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
MCTP1Q6DN14 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MCTP1Q6DN14 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MCTP1Q6DN14 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MCTP1Q6DN14 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MCTP1Q6DN14 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MCTP1Q6DN14 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MCTP1Q6DN14 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MCTP1Q6DN14 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MCTP1Q6DN14 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MCTP1Q6DN14 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MCTP1Q6DN14 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MCTP1Q6DN14 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MCTP1Q6DN14 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MCTP1Q6DN14 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MCTP1Q6DN14 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MCTP1Q6DN14 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MCTP1Q6DN14 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MCTP1Q6DN14 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MCTP1Q6DN14 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MCTP1Q6DN14 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MCTP1Q6DN14 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MCTP1Q6DN14 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MCTP1Q6DN14 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MCTP1Q6DN14 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MCTP1Q6DN14 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MCTP1Q6DN14 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MCTP1Q6DN14 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MCTP1Q6DN14 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MCTP1Q6DN14 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MCTP1Q6DN14 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MCTP1Q6DN14 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MCTP1Q6DN14 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MCTP1Q6DN14 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MCTP1Q6DN14 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MCTP1Q6DN14 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MCTP1Q6DN14 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MCTP1Q6DN14 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MCTP1Q6DN14 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
MCTP1Q6DN14 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms