Protein–RNA interactions for Protein: Q68E01

INTS3, Integrator complex subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,043 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INTS3Q68E01 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
INTS3Q68E01 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
INTS3Q68E01 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
INTS3Q68E01 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
INTS3Q68E01 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
INTS3Q68E01 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
INTS3Q68E01 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
INTS3Q68E01 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
INTS3Q68E01 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
INTS3Q68E01 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
INTS3Q68E01 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
INTS3Q68E01 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
INTS3Q68E01 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
INTS3Q68E01 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
INTS3Q68E01 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
INTS3Q68E01 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
INTS3Q68E01 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
INTS3Q68E01 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
INTS3Q68E01 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
INTS3Q68E01 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
INTS3Q68E01 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
INTS3Q68E01 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
INTS3Q68E01 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
INTS3Q68E01 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
INTS3Q68E01 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
INTS3Q68E01 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
INTS3Q68E01 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
INTS3Q68E01 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
INTS3Q68E01 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
INTS3Q68E01 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
INTS3Q68E01 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
INTS3Q68E01 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
INTS3Q68E01 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
INTS3Q68E01 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
INTS3Q68E01 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
INTS3Q68E01 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
INTS3Q68E01 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
INTS3Q68E01 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
INTS3Q68E01 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
INTS3Q68E01 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
INTS3Q68E01 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC25.09■■□□□ 1.61
INTS3Q68E01 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
INTS3Q68E01 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
INTS3Q68E01 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
INTS3Q68E01 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
INTS3Q68E01 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
INTS3Q68E01 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
INTS3Q68E01 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
INTS3Q68E01 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
INTS3Q68E01 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
INTS3Q68E01 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
INTS3Q68E01 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
INTS3Q68E01 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
INTS3Q68E01 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
INTS3Q68E01 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
INTS3Q68E01 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
INTS3Q68E01 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
INTS3Q68E01 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
INTS3Q68E01 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
INTS3Q68E01 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
INTS3Q68E01 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
INTS3Q68E01 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
INTS3Q68E01 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC25.08■■□□□ 1.6
INTS3Q68E01 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
INTS3Q68E01 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
INTS3Q68E01 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
INTS3Q68E01 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
INTS3Q68E01 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
INTS3Q68E01 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
INTS3Q68E01 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
INTS3Q68E01 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
INTS3Q68E01 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
INTS3Q68E01 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
INTS3Q68E01 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
INTS3Q68E01 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
INTS3Q68E01 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
INTS3Q68E01 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
INTS3Q68E01 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
INTS3Q68E01 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
INTS3Q68E01 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
INTS3Q68E01 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
INTS3Q68E01 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
INTS3Q68E01 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
INTS3Q68E01 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
INTS3Q68E01 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
INTS3Q68E01 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
INTS3Q68E01 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
INTS3Q68E01 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
INTS3Q68E01 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
INTS3Q68E01 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC25.06■■□□□ 1.6
INTS3Q68E01 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
INTS3Q68E01 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
INTS3Q68E01 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
INTS3Q68E01 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
INTS3Q68E01 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
INTS3Q68E01 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
INTS3Q68E01 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
INTS3Q68E01 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
INTS3Q68E01 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
INTS3Q68E01 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms