Protein–RNA interactions for Protein: Q68CJ9

CREB3L3, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 3-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB3L3Q68CJ9 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CREB3L3Q68CJ9 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CREB3L3Q68CJ9 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CREB3L3Q68CJ9 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CREB3L3Q68CJ9 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
CREB3L3Q68CJ9 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CREB3L3Q68CJ9 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CREB3L3Q68CJ9 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CREB3L3Q68CJ9 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CREB3L3Q68CJ9 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CREB3L3Q68CJ9 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CREB3L3Q68CJ9 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CREB3L3Q68CJ9 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CREB3L3Q68CJ9 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CREB3L3Q68CJ9 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CREB3L3Q68CJ9 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CREB3L3Q68CJ9 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CREB3L3Q68CJ9 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CREB3L3Q68CJ9 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CREB3L3Q68CJ9 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CREB3L3Q68CJ9 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CREB3L3Q68CJ9 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CREB3L3Q68CJ9 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CREB3L3Q68CJ9 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CREB3L3Q68CJ9 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CREB3L3Q68CJ9 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CREB3L3Q68CJ9 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CREB3L3Q68CJ9 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CREB3L3Q68CJ9 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CREB3L3Q68CJ9 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CREB3L3Q68CJ9 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CREB3L3Q68CJ9 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CREB3L3Q68CJ9 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CREB3L3Q68CJ9 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CREB3L3Q68CJ9 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CREB3L3Q68CJ9 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
CREB3L3Q68CJ9 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
CREB3L3Q68CJ9 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CREB3L3Q68CJ9 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CREB3L3Q68CJ9 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CREB3L3Q68CJ9 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CREB3L3Q68CJ9 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CREB3L3Q68CJ9 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
CREB3L3Q68CJ9 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CREB3L3Q68CJ9 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CREB3L3Q68CJ9 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CREB3L3Q68CJ9 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CREB3L3Q68CJ9 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CREB3L3Q68CJ9 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CREB3L3Q68CJ9 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CREB3L3Q68CJ9 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CREB3L3Q68CJ9 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CREB3L3Q68CJ9 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CREB3L3Q68CJ9 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CREB3L3Q68CJ9 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CREB3L3Q68CJ9 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CREB3L3Q68CJ9 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CREB3L3Q68CJ9 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CREB3L3Q68CJ9 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CREB3L3Q68CJ9 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CREB3L3Q68CJ9 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CREB3L3Q68CJ9 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CREB3L3Q68CJ9 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CREB3L3Q68CJ9 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CREB3L3Q68CJ9 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CREB3L3Q68CJ9 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CREB3L3Q68CJ9 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CREB3L3Q68CJ9 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CREB3L3Q68CJ9 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CREB3L3Q68CJ9 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CREB3L3Q68CJ9 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CREB3L3Q68CJ9 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CREB3L3Q68CJ9 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CREB3L3Q68CJ9 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CREB3L3Q68CJ9 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CREB3L3Q68CJ9 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CREB3L3Q68CJ9 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CREB3L3Q68CJ9 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CREB3L3Q68CJ9 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CREB3L3Q68CJ9 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CREB3L3Q68CJ9 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CREB3L3Q68CJ9 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CREB3L3Q68CJ9 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CREB3L3Q68CJ9 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CREB3L3Q68CJ9 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CREB3L3Q68CJ9 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CREB3L3Q68CJ9 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CREB3L3Q68CJ9 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CREB3L3Q68CJ9 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CREB3L3Q68CJ9 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CREB3L3Q68CJ9 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
CREB3L3Q68CJ9 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CREB3L3Q68CJ9 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CREB3L3Q68CJ9 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
CREB3L3Q68CJ9 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CREB3L3Q68CJ9 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CREB3L3Q68CJ9 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CREB3L3Q68CJ9 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CREB3L3Q68CJ9 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CREB3L3Q68CJ9 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms