Protein–RNA interactions for Protein: Q5VZK9

CARMIL1, F-actin-uncapping protein LRRC16A, humanhuman

Predictions only

Length 1,371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARMIL1Q5VZK9 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC32.37■■■□□ 2.77
CARMIL1Q5VZK9 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
CARMIL1Q5VZK9 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
CARMIL1Q5VZK9 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
CARMIL1Q5VZK9 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
CARMIL1Q5VZK9 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC32.37■■■□□ 2.77
CARMIL1Q5VZK9 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
CARMIL1Q5VZK9 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC32.37■■■□□ 2.77
CARMIL1Q5VZK9 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.37■■■□□ 2.77
CARMIL1Q5VZK9 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
CARMIL1Q5VZK9 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
CARMIL1Q5VZK9 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC32.37■■■□□ 2.77
CARMIL1Q5VZK9 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC32.37■■■□□ 2.77
CARMIL1Q5VZK9 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
CARMIL1Q5VZK9 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
CARMIL1Q5VZK9 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
CARMIL1Q5VZK9 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC32.36■■■□□ 2.77
CARMIL1Q5VZK9 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC32.36■■■□□ 2.77
CARMIL1Q5VZK9 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC32.36■■■□□ 2.77
CARMIL1Q5VZK9 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
CARMIL1Q5VZK9 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC32.36■■■□□ 2.77
CARMIL1Q5VZK9 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
CARMIL1Q5VZK9 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC32.36■■■□□ 2.77
CARMIL1Q5VZK9 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
CARMIL1Q5VZK9 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC32.35■■■□□ 2.77
CARMIL1Q5VZK9 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
CARMIL1Q5VZK9 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC32.35■■■□□ 2.77
CARMIL1Q5VZK9 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.35■■■□□ 2.77
CARMIL1Q5VZK9 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC32.35■■■□□ 2.77
CARMIL1Q5VZK9 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC32.35■■■□□ 2.77
CARMIL1Q5VZK9 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
CARMIL1Q5VZK9 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
CARMIL1Q5VZK9 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
CARMIL1Q5VZK9 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
CARMIL1Q5VZK9 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
CARMIL1Q5VZK9 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
CARMIL1Q5VZK9 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC32.34■■■□□ 2.77
CARMIL1Q5VZK9 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC32.34■■■□□ 2.77
CARMIL1Q5VZK9 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC32.34■■■□□ 2.77
CARMIL1Q5VZK9 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC32.34■■■□□ 2.77
CARMIL1Q5VZK9 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.34■■■□□ 2.77
CARMIL1Q5VZK9 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
CARMIL1Q5VZK9 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.34■■■□□ 2.77
CARMIL1Q5VZK9 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
CARMIL1Q5VZK9 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
CARMIL1Q5VZK9 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC32.33■■■□□ 2.77
CARMIL1Q5VZK9 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
CARMIL1Q5VZK9 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
CARMIL1Q5VZK9 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.77
CARMIL1Q5VZK9 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC32.32■■■□□ 2.77
CARMIL1Q5VZK9 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC32.32■■■□□ 2.77
CARMIL1Q5VZK9 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC32.32■■■□□ 2.77
CARMIL1Q5VZK9 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC32.32■■■□□ 2.77
CARMIL1Q5VZK9 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC32.32■■■□□ 2.76
CARMIL1Q5VZK9 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
CARMIL1Q5VZK9 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
CARMIL1Q5VZK9 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
CARMIL1Q5VZK9 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.32■■■□□ 2.76
CARMIL1Q5VZK9 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.32■■■□□ 2.76
CARMIL1Q5VZK9 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC32.32■■■□□ 2.76
CARMIL1Q5VZK9 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
CARMIL1Q5VZK9 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.32■■■□□ 2.76
CARMIL1Q5VZK9 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC32.32■■■□□ 2.76
CARMIL1Q5VZK9 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC32.32■■■□□ 2.76
CARMIL1Q5VZK9 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.32■■■□□ 2.76
CARMIL1Q5VZK9 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
CARMIL1Q5VZK9 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC32.31■■■□□ 2.76
CARMIL1Q5VZK9 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC32.31■■■□□ 2.76
CARMIL1Q5VZK9 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
CARMIL1Q5VZK9 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC32.31■■■□□ 2.76
CARMIL1Q5VZK9 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
CARMIL1Q5VZK9 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
CARMIL1Q5VZK9 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.31■■■□□ 2.76
CARMIL1Q5VZK9 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC32.31■■■□□ 2.76
CARMIL1Q5VZK9 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC32.31■■■□□ 2.76
CARMIL1Q5VZK9 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC32.31■■■□□ 2.76
CARMIL1Q5VZK9 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC32.31■■■□□ 2.76
CARMIL1Q5VZK9 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC32.3■■■□□ 2.76
CARMIL1Q5VZK9 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.3■■■□□ 2.76
CARMIL1Q5VZK9 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
CARMIL1Q5VZK9 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
CARMIL1Q5VZK9 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
CARMIL1Q5VZK9 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.3■■■□□ 2.76
CARMIL1Q5VZK9 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
CARMIL1Q5VZK9 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
CARMIL1Q5VZK9 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.29■■■□□ 2.76
CARMIL1Q5VZK9 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
CARMIL1Q5VZK9 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
CARMIL1Q5VZK9 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
CARMIL1Q5VZK9 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.29■■■□□ 2.76
CARMIL1Q5VZK9 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC32.29■■■□□ 2.76
CARMIL1Q5VZK9 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC32.29■■■□□ 2.76
CARMIL1Q5VZK9 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.29■■■□□ 2.76
CARMIL1Q5VZK9 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC32.29■■■□□ 2.76
CARMIL1Q5VZK9 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC32.29■■■□□ 2.76
CARMIL1Q5VZK9 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC32.29■■■□□ 2.76
CARMIL1Q5VZK9 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC32.29■■■□□ 2.76
CARMIL1Q5VZK9 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC32.29■■■□□ 2.76
CARMIL1Q5VZK9 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC32.29■■■□□ 2.76
CARMIL1Q5VZK9 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.29■■■□□ 2.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms