Protein–RNA interactions for Protein: Q5VU43

PDE4DIP, Myomegalin, humanhuman

Predictions only

Length 2,346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4DIPQ5VU43 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PDE4DIPQ5VU43 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
PDE4DIPQ5VU43 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PDE4DIPQ5VU43 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDE4DIPQ5VU43 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDE4DIPQ5VU43 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDE4DIPQ5VU43 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDE4DIPQ5VU43 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDE4DIPQ5VU43 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDE4DIPQ5VU43 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDE4DIPQ5VU43 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
PDE4DIPQ5VU43 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDE4DIPQ5VU43 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDE4DIPQ5VU43 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDE4DIPQ5VU43 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDE4DIPQ5VU43 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDE4DIPQ5VU43 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PDE4DIPQ5VU43 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDE4DIPQ5VU43 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDE4DIPQ5VU43 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDE4DIPQ5VU43 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDE4DIPQ5VU43 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDE4DIPQ5VU43 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDE4DIPQ5VU43 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDE4DIPQ5VU43 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDE4DIPQ5VU43 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDE4DIPQ5VU43 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDE4DIPQ5VU43 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDE4DIPQ5VU43 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDE4DIPQ5VU43 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PDE4DIPQ5VU43 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PDE4DIPQ5VU43 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PDE4DIPQ5VU43 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PDE4DIPQ5VU43 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
PDE4DIPQ5VU43 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PDE4DIPQ5VU43 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PDE4DIPQ5VU43 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PDE4DIPQ5VU43 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PDE4DIPQ5VU43 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PDE4DIPQ5VU43 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PDE4DIPQ5VU43 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PDE4DIPQ5VU43 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PDE4DIPQ5VU43 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
PDE4DIPQ5VU43 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PDE4DIPQ5VU43 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PDE4DIPQ5VU43 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PDE4DIPQ5VU43 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PDE4DIPQ5VU43 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PDE4DIPQ5VU43 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PDE4DIPQ5VU43 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PDE4DIPQ5VU43 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PDE4DIPQ5VU43 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PDE4DIPQ5VU43 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PDE4DIPQ5VU43 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PDE4DIPQ5VU43 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PDE4DIPQ5VU43 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PDE4DIPQ5VU43 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PDE4DIPQ5VU43 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PDE4DIPQ5VU43 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
PDE4DIPQ5VU43 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PDE4DIPQ5VU43 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PDE4DIPQ5VU43 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PDE4DIPQ5VU43 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PDE4DIPQ5VU43 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PDE4DIPQ5VU43 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PDE4DIPQ5VU43 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PDE4DIPQ5VU43 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PDE4DIPQ5VU43 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PDE4DIPQ5VU43 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PDE4DIPQ5VU43 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
PDE4DIPQ5VU43 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PDE4DIPQ5VU43 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
PDE4DIPQ5VU43 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PDE4DIPQ5VU43 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PDE4DIPQ5VU43 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PDE4DIPQ5VU43 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PDE4DIPQ5VU43 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PDE4DIPQ5VU43 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PDE4DIPQ5VU43 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PDE4DIPQ5VU43 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PDE4DIPQ5VU43 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PDE4DIPQ5VU43 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PDE4DIPQ5VU43 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
PDE4DIPQ5VU43 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PDE4DIPQ5VU43 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PDE4DIPQ5VU43 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PDE4DIPQ5VU43 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PDE4DIPQ5VU43 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PDE4DIPQ5VU43 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PDE4DIPQ5VU43 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PDE4DIPQ5VU43 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PDE4DIPQ5VU43 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PDE4DIPQ5VU43 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
PDE4DIPQ5VU43 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PDE4DIPQ5VU43 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PDE4DIPQ5VU43 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PDE4DIPQ5VU43 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
PDE4DIPQ5VU43 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PDE4DIPQ5VU43 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PDE4DIPQ5VU43 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms