Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTL8

PRPF38B, Pre-mRNA-splicing factor 38B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 546 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF38BQ5VTL8 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PRPF38BQ5VTL8 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PRPF38BQ5VTL8 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PRPF38BQ5VTL8 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PRPF38BQ5VTL8 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PRPF38BQ5VTL8 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
PRPF38BQ5VTL8 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PRPF38BQ5VTL8 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PRPF38BQ5VTL8 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PRPF38BQ5VTL8 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PRPF38BQ5VTL8 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PRPF38BQ5VTL8 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
PRPF38BQ5VTL8 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PRPF38BQ5VTL8 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PRPF38BQ5VTL8 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PRPF38BQ5VTL8 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PRPF38BQ5VTL8 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PRPF38BQ5VTL8 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PRPF38BQ5VTL8 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PRPF38BQ5VTL8 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PRPF38BQ5VTL8 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PRPF38BQ5VTL8 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PRPF38BQ5VTL8 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PRPF38BQ5VTL8 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PRPF38BQ5VTL8 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PRPF38BQ5VTL8 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PRPF38BQ5VTL8 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
PRPF38BQ5VTL8 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PRPF38BQ5VTL8 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PRPF38BQ5VTL8 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
PRPF38BQ5VTL8 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PRPF38BQ5VTL8 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
PRPF38BQ5VTL8 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PRPF38BQ5VTL8 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PRPF38BQ5VTL8 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PRPF38BQ5VTL8 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PRPF38BQ5VTL8 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PRPF38BQ5VTL8 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PRPF38BQ5VTL8 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PRPF38BQ5VTL8 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PRPF38BQ5VTL8 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PRPF38BQ5VTL8 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PRPF38BQ5VTL8 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PRPF38BQ5VTL8 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PRPF38BQ5VTL8 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PRPF38BQ5VTL8 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PRPF38BQ5VTL8 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PRPF38BQ5VTL8 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PRPF38BQ5VTL8 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PRPF38BQ5VTL8 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PRPF38BQ5VTL8 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PRPF38BQ5VTL8 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PRPF38BQ5VTL8 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PRPF38BQ5VTL8 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PRPF38BQ5VTL8 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PRPF38BQ5VTL8 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PRPF38BQ5VTL8 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PRPF38BQ5VTL8 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PRPF38BQ5VTL8 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PRPF38BQ5VTL8 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PRPF38BQ5VTL8 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PRPF38BQ5VTL8 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PRPF38BQ5VTL8 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PRPF38BQ5VTL8 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
PRPF38BQ5VTL8 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PRPF38BQ5VTL8 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PRPF38BQ5VTL8 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PRPF38BQ5VTL8 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PRPF38BQ5VTL8 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
PRPF38BQ5VTL8 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PRPF38BQ5VTL8 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PRPF38BQ5VTL8 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PRPF38BQ5VTL8 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PRPF38BQ5VTL8 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PRPF38BQ5VTL8 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
PRPF38BQ5VTL8 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PRPF38BQ5VTL8 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PRPF38BQ5VTL8 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PRPF38BQ5VTL8 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PRPF38BQ5VTL8 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PRPF38BQ5VTL8 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PRPF38BQ5VTL8 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PRPF38BQ5VTL8 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PRPF38BQ5VTL8 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PRPF38BQ5VTL8 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PRPF38BQ5VTL8 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PRPF38BQ5VTL8 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PRPF38BQ5VTL8 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PRPF38BQ5VTL8 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PRPF38BQ5VTL8 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PRPF38BQ5VTL8 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PRPF38BQ5VTL8 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PRPF38BQ5VTL8 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PRPF38BQ5VTL8 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PRPF38BQ5VTL8 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PRPF38BQ5VTL8 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PRPF38BQ5VTL8 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
PRPF38BQ5VTL8 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PRPF38BQ5VTL8 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PRPF38BQ5VTL8 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms