Protein–RNA interactions for Protein: Q5T0N1

CFAP70, Cilia- and flagella-associated protein 70, humanhuman

Predictions only

Length 1,121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP70Q5T0N1 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CFAP70Q5T0N1 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CFAP70Q5T0N1 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CFAP70Q5T0N1 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CFAP70Q5T0N1 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CFAP70Q5T0N1 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CFAP70Q5T0N1 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CFAP70Q5T0N1 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CFAP70Q5T0N1 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
CFAP70Q5T0N1 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CFAP70Q5T0N1 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
CFAP70Q5T0N1 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CFAP70Q5T0N1 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CFAP70Q5T0N1 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CFAP70Q5T0N1 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CFAP70Q5T0N1 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CFAP70Q5T0N1 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CFAP70Q5T0N1 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CFAP70Q5T0N1 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CFAP70Q5T0N1 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CFAP70Q5T0N1 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CFAP70Q5T0N1 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CFAP70Q5T0N1 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
CFAP70Q5T0N1 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CFAP70Q5T0N1 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CFAP70Q5T0N1 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CFAP70Q5T0N1 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CFAP70Q5T0N1 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CFAP70Q5T0N1 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CFAP70Q5T0N1 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CFAP70Q5T0N1 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CFAP70Q5T0N1 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CFAP70Q5T0N1 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CFAP70Q5T0N1 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CFAP70Q5T0N1 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CFAP70Q5T0N1 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CFAP70Q5T0N1 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
CFAP70Q5T0N1 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CFAP70Q5T0N1 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CFAP70Q5T0N1 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CFAP70Q5T0N1 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CFAP70Q5T0N1 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CFAP70Q5T0N1 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CFAP70Q5T0N1 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CFAP70Q5T0N1 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CFAP70Q5T0N1 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CFAP70Q5T0N1 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CFAP70Q5T0N1 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CFAP70Q5T0N1 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CFAP70Q5T0N1 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CFAP70Q5T0N1 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CFAP70Q5T0N1 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CFAP70Q5T0N1 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CFAP70Q5T0N1 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CFAP70Q5T0N1 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CFAP70Q5T0N1 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
CFAP70Q5T0N1 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CFAP70Q5T0N1 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CFAP70Q5T0N1 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
CFAP70Q5T0N1 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CFAP70Q5T0N1 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CFAP70Q5T0N1 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CFAP70Q5T0N1 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CFAP70Q5T0N1 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CFAP70Q5T0N1 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CFAP70Q5T0N1 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CFAP70Q5T0N1 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CFAP70Q5T0N1 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CFAP70Q5T0N1 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
CFAP70Q5T0N1 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CFAP70Q5T0N1 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CFAP70Q5T0N1 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CFAP70Q5T0N1 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CFAP70Q5T0N1 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CFAP70Q5T0N1 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CFAP70Q5T0N1 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CFAP70Q5T0N1 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.08
CFAP70Q5T0N1 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
CFAP70Q5T0N1 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
CFAP70Q5T0N1 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CFAP70Q5T0N1 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CFAP70Q5T0N1 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CFAP70Q5T0N1 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CFAP70Q5T0N1 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CFAP70Q5T0N1 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CFAP70Q5T0N1 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CFAP70Q5T0N1 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CFAP70Q5T0N1 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
CFAP70Q5T0N1 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
CFAP70Q5T0N1 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CFAP70Q5T0N1 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
CFAP70Q5T0N1 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CFAP70Q5T0N1 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC28■■■□□ 2.07
CFAP70Q5T0N1 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
CFAP70Q5T0N1 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CFAP70Q5T0N1 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CFAP70Q5T0N1 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC28■■■□□ 2.07
CFAP70Q5T0N1 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
CFAP70Q5T0N1 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC28■■■□□ 2.07
CFAP70Q5T0N1 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.6 ms