Protein–RNA interactions for Protein: Q5T0J3

C1orf220, Putative uncharacterized protein C1orf220, humanhuman

Predictions only

Length 134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf220Q5T0J3 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
C1orf220Q5T0J3 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
C1orf220Q5T0J3 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
C1orf220Q5T0J3 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
C1orf220Q5T0J3 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
C1orf220Q5T0J3 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
C1orf220Q5T0J3 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
C1orf220Q5T0J3 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
C1orf220Q5T0J3 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
C1orf220Q5T0J3 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
C1orf220Q5T0J3 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
C1orf220Q5T0J3 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
C1orf220Q5T0J3 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
C1orf220Q5T0J3 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
C1orf220Q5T0J3 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
C1orf220Q5T0J3 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
C1orf220Q5T0J3 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
C1orf220Q5T0J3 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
C1orf220Q5T0J3 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
C1orf220Q5T0J3 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
C1orf220Q5T0J3 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
C1orf220Q5T0J3 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
C1orf220Q5T0J3 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
C1orf220Q5T0J3 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
C1orf220Q5T0J3 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
C1orf220Q5T0J3 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
C1orf220Q5T0J3 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
C1orf220Q5T0J3 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
C1orf220Q5T0J3 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
C1orf220Q5T0J3 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
C1orf220Q5T0J3 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
C1orf220Q5T0J3 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
C1orf220Q5T0J3 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
C1orf220Q5T0J3 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
C1orf220Q5T0J3 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
C1orf220Q5T0J3 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
C1orf220Q5T0J3 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
C1orf220Q5T0J3 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
C1orf220Q5T0J3 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
C1orf220Q5T0J3 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
C1orf220Q5T0J3 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
C1orf220Q5T0J3 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
C1orf220Q5T0J3 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
C1orf220Q5T0J3 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
C1orf220Q5T0J3 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
C1orf220Q5T0J3 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
C1orf220Q5T0J3 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
C1orf220Q5T0J3 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
C1orf220Q5T0J3 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
C1orf220Q5T0J3 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
C1orf220Q5T0J3 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
C1orf220Q5T0J3 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
C1orf220Q5T0J3 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
C1orf220Q5T0J3 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
C1orf220Q5T0J3 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
C1orf220Q5T0J3 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
C1orf220Q5T0J3 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
C1orf220Q5T0J3 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
C1orf220Q5T0J3 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
C1orf220Q5T0J3 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
C1orf220Q5T0J3 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
C1orf220Q5T0J3 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
C1orf220Q5T0J3 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
C1orf220Q5T0J3 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
C1orf220Q5T0J3 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
C1orf220Q5T0J3 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
C1orf220Q5T0J3 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
C1orf220Q5T0J3 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
C1orf220Q5T0J3 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
C1orf220Q5T0J3 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
C1orf220Q5T0J3 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
C1orf220Q5T0J3 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
C1orf220Q5T0J3 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
C1orf220Q5T0J3 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
C1orf220Q5T0J3 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
C1orf220Q5T0J3 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
C1orf220Q5T0J3 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
C1orf220Q5T0J3 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
C1orf220Q5T0J3 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.02
C1orf220Q5T0J3 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
C1orf220Q5T0J3 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
C1orf220Q5T0J3 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
C1orf220Q5T0J3 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
C1orf220Q5T0J3 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
C1orf220Q5T0J3 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
C1orf220Q5T0J3 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
C1orf220Q5T0J3 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
C1orf220Q5T0J3 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
C1orf220Q5T0J3 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
C1orf220Q5T0J3 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
C1orf220Q5T0J3 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
C1orf220Q5T0J3 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
C1orf220Q5T0J3 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
C1orf220Q5T0J3 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
C1orf220Q5T0J3 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
C1orf220Q5T0J3 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
C1orf220Q5T0J3 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
C1orf220Q5T0J3 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
C1orf220Q5T0J3 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
C1orf220Q5T0J3 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.2 ms